More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_B0001 on replicon NC_007641
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007641  Rru_B0001  putative partition protein  100 
 
 		 216 aa  433  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.37 
 
 		 213 aa  185  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000187977 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3600  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  47.22 
 
 		 219 aa  175  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6541  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.97 
 
 		 221 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.975947  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2401  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.91 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7043  hypothetical protein  46.46 
 
 		 227 aa  169  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.284311  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7739  hypothetical protein  46.97 
 
 		 220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3684  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.07 
 
 		 216 aa  155  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.444567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1360  ParA family protein, putative  45.19 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0573305  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0021  hypothetical protein  37.67 
 
 		 227 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0145504  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7009  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.62 
 
 		 223 aa  132  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.295052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5389  hypothetical protein  35.81 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4960  hypothetical protein  35.81 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.05 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  32.86 
 
 		 213 aa  112  5e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4776  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.38 
 
 		 209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.74468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.09 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.54 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  34.98 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.6 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.88 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0226442  normal  0.408806 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.8 
 
 		 217 aa  102  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  30.04 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.27 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.8 
 
 		 212 aa  98.6  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.86 
 
 		 212 aa  97.1  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.07 
 
 		 212 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0025  para protein  28.44 
 
 		 222 aa  95.9  4e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00204905  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  31.97 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.64 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.38 
 
 		 212 aa  94.4  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 212 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 212 aa  93.2  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 212 aa  93.2  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.27 
 
 		 212 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.16 
 
 		 217 aa  92.4  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5043  hypothetical protein  33.98 
 
 		 229 aa  92  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000269108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.12 
 
 		 212 aa  91.7  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  33.8 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.86 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.65 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.18 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  33.65 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.7 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.18 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.46 
 
 		 217 aa  89.7  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.76 
 
 		 212 aa  89.4  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.46 
 
 		 217 aa  89.4  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.16 
 
 		 212 aa  89  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.46 
 
 		 217 aa  89  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.7 
 
 		 212 aa  88.6  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.06 
 
 		 212 aa  88.2  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  37.06 
 
 		 212 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1377  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.93 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.39 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.76 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.46 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.46 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.49 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2330  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.76 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.1 
 
 		 217 aa  85.5  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.28 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  37.06 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2325  hypothetical protein  29.03 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.338387  normal  0.476496 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.06 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.76 
 
 		 252 aa  81.6  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.19 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7432  putative partition protein  40.56 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.529714 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1033  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.56 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0985734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.23 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  29.23 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4151  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.67 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1143  ParA family protein  29.02 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661225  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2114  ParA family protein  29.02 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579771  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1422  ParA family protein  29.02 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000341933  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1503  ParA family protein  29.02 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000197714  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3289  ParA family protein  29.02 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000336314  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3176  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  29.02 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00741579  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2409  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  29.02 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2879  hypothetical protein  27.65 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187633  hitchhiker  0.00000000100318 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  29.74 
 
 		 220 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.65 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.5 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.5 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.53 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144706  hitchhiker  0.0000785935 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.5 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.98 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.98 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.98 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.98 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4285  chromosome partitioning ATPase protein-like  31.34 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1769  hypothetical protein  26.27 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.00507269 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  37.58 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5819  plasmid partitioning ATPase  31.63 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5343  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.12 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6875  ATPases involved in chromosome partitioning-like protein  27.43 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6252  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  26.34 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0236598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1295  hypothetical protein  29.95 
 
 		 247 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03280  parA family protein  29.91 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0183  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.69 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>