More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1377 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1377  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 		 211 aa  434  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.61 
 
 		 213 aa  285  2.9999999999999996e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  49.05 
 
 		 213 aa  210  1e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.9 
 
 		 210 aa  158  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5389  hypothetical protein  38.76 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4960  hypothetical protein  38.76 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.43 
 
 		 215 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0226442  normal  0.408806 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2373  hypothetical protein  38.32 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.714384  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3684  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.62 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.444567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1295  hypothetical protein  37.38 
 
 		 247 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1281  hypothetical protein  37.85 
 
 		 247 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1769  hypothetical protein  33.02 
 
 		 222 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.00507269 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2325  hypothetical protein  33.02 
 
 		 222 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.338387  normal  0.476496 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3331  hypothetical protein  37.85 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2879  hypothetical protein  33.49 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187633  hitchhiker  0.00000000100318 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1214  hypothetical protein  37.38 
 
 		 260 aa  116  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1285  hypothetical protein  37.38 
 
 		 260 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0462071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1215  hypothetical protein  36.92 
 
 		 260 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1359  hypothetical protein  38.32 
 
 		 280 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000528372 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3004  hypothetical protein  38.32 
 
 		 285 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3019  hypothetical protein  37.85 
 
 		 280 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1107  hypothetical protein  37.38 
 
 		 248 aa  112  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3162  hypothetical protein  37.85 
 
 		 280 aa  111  9e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.770866  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03280  parA family protein  35.81 
 
 		 231 aa  111  9e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1422  hypothetical protein  36.45 
 
 		 247 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1535  hypothetical protein  35.98 
 
 		 247 aa  108  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.295146 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2808  hypothetical protein  35.85 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2428  hypothetical protein  35.38 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.138637  normal  0.0455143 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2498  hypothetical protein  35.38 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.349306  normal  0.0447038 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1552  hypothetical protein  35.85 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2590  hypothetical protein  35.38 
 
 		 222 aa  105  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.300803  normal  0.0153957 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1285  hypothetical protein  33.64 
 
 		 222 aa  103  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.016663 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0008  plasmid partition protein A, putative  32.71 
 
 		 219 aa  103  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745248  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5043  hypothetical protein  34.26 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000269108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  31.82 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.58 
 
 		 222 aa  102  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0032  putative plasmid partition protein A  32.71 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0137071  normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.88 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0207  parA family protein  33.64 
 
 		 222 aa  102  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1699  hypothetical protein  34.91 
 
 		 222 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.228644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1662  hypothetical protein  34.91 
 
 		 222 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00377419  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2680  hypothetical protein  34.91 
 
 		 222 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0196753 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1677  hypothetical protein  34.91 
 
 		 222 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.32 
 
 		 217 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  32.08 
 
 		 207 aa  99.4  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.18 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1451  hypothetical protein  33.49 
 
 		 224 aa  97.4  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00188654  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.95 
 
 		 212 aa  97.1  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.65 
 
 		 212 aa  97.4  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.9 
 
 		 217 aa  97.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.21 
 
 		 212 aa  96.3  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.22 
 
 		 217 aa  95.1  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2431  hypothetical protein  33.02 
 
 		 222 aa  94.7  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.44122  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  32.71 
 
 		 220 aa  93.6  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.71 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.7 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.7 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  27.27 
 
 		 228 aa  92.4  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.95 
 
 		 213 aa  92.4  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000187977 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.4 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.51 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.21 
 
 		 217 aa  89.7  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0021  hypothetical protein  29.82 
 
 		 227 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0145504  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.63 
 
 		 217 aa  89.4  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2401  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.44 
 
 		 213 aa  89.4  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.71 
 
 		 217 aa  89  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7009  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.64 
 
 		 223 aa  88.6  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.295052  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  35.35 
 
 		 212 aa  88.6  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0001  putative partition protein  30.93 
 
 		 216 aa  87.8  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.88 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.88 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.57 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.88 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.53 
 
 		 209 aa  85.9  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.42 
 
 		 212 aa  86.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.42 
 
 		 212 aa  85.9  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.42 
 
 		 212 aa  85.9  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.42 
 
 		 212 aa  85.5  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.42 
 
 		 212 aa  85.5  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.95 
 
 		 212 aa  85.1  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  33.95 
 
 		 212 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.88 
 
 		 212 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4776  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.55 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.74468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1360  ParA family protein, putative  29.91 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0573305  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.49 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2330  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.36 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.49 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.63 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.95 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.49 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0025  para protein  31.41 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00204905  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4285  chromosome partitioning ATPase protein-like  29.77 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5343  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.64 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.42 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0443  ParA-like protein  28.95 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.190603  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  34.42 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5819  plasmid partitioning ATPase  27.7 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6252  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  28.7 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0236598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  30.23 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.36 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>