More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_7009 on replicon NC_013733
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013733  Slin_7009  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 		 223 aa  458  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.295052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6541  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.43 
 
 		 221 aa  174  8e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.975947  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7043  hypothetical protein  46.43 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.284311  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7739  hypothetical protein  46.43 
 
 		 220 aa  162  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.12 
 
 		 213 aa  148  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000187977 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1360  ParA family protein, putative  40.76 
 
 		 217 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0573305  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3600  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  40.65 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2401  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.53 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0001  putative partition protein  37.62 
 
 		 216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0021  hypothetical protein  34.74 
 
 		 227 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0145504  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3684  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.88 
 
 		 216 aa  122  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.444567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.65 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0226442  normal  0.408806 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.87 
 
 		 207 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.94 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.3 
 
 		 214 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 209 aa  108  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.21 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  32.47 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.16 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.36 
 
 		 212 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.87 
 
 		 217 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.24 
 
 		 236 aa  100  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144706  hitchhiker  0.0000785935 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4776  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.8 
 
 		 209 aa  99.4  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.74468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.2 
 
 		 212 aa  99.4  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.58 
 
 		 217 aa  98.6  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.04 
 
 		 212 aa  98.6  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.58 
 
 		 217 aa  98.6  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.49 
 
 		 212 aa  98.6  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.05 
 
 		 217 aa  97.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.02 
 
 		 212 aa  96.3  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.63 
 
 		 212 aa  96.7  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.05 
 
 		 217 aa  95.5  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.51 
 
 		 217 aa  94.7  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2325  hypothetical protein  29.63 
 
 		 222 aa  92.4  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.338387  normal  0.476496 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.63 
 
 		 212 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.67 
 
 		 212 aa  92.4  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.16 
 
 		 212 aa  92  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.63 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  29.68 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  31.8 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.1 
 
 		 217 aa  90.5  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.09 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.63 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.63 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.09 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.63 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  25.79 
 
 		 228 aa  89.7  4e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.09 
 
 		 212 aa  89  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4960  hypothetical protein  30.48 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5389  hypothetical protein  30.48 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.5 
 
 		 217 aa  88.6  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1377  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.64 
 
 		 211 aa  88.6  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.16 
 
 		 212 aa  88.6  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  31.8 
 
 		 220 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  30.23 
 
 		 213 aa  87.8  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.7 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1769  hypothetical protein  28.24 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.00507269 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2879  hypothetical protein  29.49 
 
 		 222 aa  86.7  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187633  hitchhiker  0.00000000100318 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.04 
 
 		 211 aa  86.7  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.31 
 
 		 212 aa  86.3  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  31.02 
 
 		 212 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.77 
 
 		 212 aa  85.5  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  30.23 
 
 		 212 aa  85.1  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.92 
 
 		 209 aa  85.1  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.43 
 
 		 212 aa  85.5  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.58 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.29 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2330  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.05 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2428  hypothetical protein  31.02 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.138637  normal  0.0455143 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2498  hypothetical protein  31.02 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.349306  normal  0.0447038 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2590  hypothetical protein  31.02 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.300803  normal  0.0153957 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.94 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1662  hypothetical protein  31.02 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00377419  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1677  hypothetical protein  31.02 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03280  parA family protein  31.82 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2680  hypothetical protein  31.02 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0196753 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1699  hypothetical protein  31.02 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.228644  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2808  hypothetical protein  30.09 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1552  hypothetical protein  31.02 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  30.54 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.21 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1978  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.47 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3331  hypothetical protein  30.62 
 
 		 260 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.45 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0025  para protein  26.19 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00204905  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.37 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1281  hypothetical protein  30.14 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1451  hypothetical protein  31.02 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00188654  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.5 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.37 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1285  hypothetical protein  29.17 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.016663 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1214  hypothetical protein  30.14 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1285  hypothetical protein  30.14 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0462071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7432  putative partition protein  33.51 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.529714 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2431  hypothetical protein  29.17 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.44122  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1745  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.29 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.543877  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1215  hypothetical protein  30.14 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5343  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.47 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.45 
 
 		 220 aa  72  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0003  partition protein  26.67 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000179256  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>