More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4776 on replicon NC_008761
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008761  Pnap_4776  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 		 209 aa  423  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.74468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3684  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.12 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.444567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.61 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.81 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.81 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0001  putative partition protein  37.38 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.5 
 
 		 217 aa  118  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.44 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7009  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.8 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.295052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.91 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.24 
 
 		 217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.97 
 
 		 212 aa  112  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.5 
 
 		 212 aa  112  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.14 
 
 		 212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  36.49 
 
 		 220 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.63 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.91 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.55 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.02 
 
 		 217 aa  105  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  28.31 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  32.23 
 
 		 207 aa  105  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.21 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  35.51 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.29 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6541  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.2 
 
 		 221 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.975947  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.21 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 		 207 aa  101  9e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0021  hypothetical protein  35.38 
 
 		 227 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0145504  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3600  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  36.32 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.02 
 
 		 213 aa  99.8  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000187977 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.21 
 
 		 212 aa  99.4  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2401  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.55 
 
 		 213 aa  98.6  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7432  putative partition protein  36.84 
 
 		 212 aa  98.2  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.529714 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1978  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.65 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.29 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.55 
 
 		 210 aa  95.9  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5389  hypothetical protein  33.33 
 
 		 213 aa  94  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4960  hypothetical protein  33.33 
 
 		 213 aa  94  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.49 
 
 		 213 aa  94  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.27 
 
 		 215 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0226442  normal  0.408806 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.21 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.33 
 
 		 214 aa  94  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1377  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.55 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.77 
 
 		 209 aa  94  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7043  hypothetical protein  32.63 
 
 		 227 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.284311  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  32.84 
 
 		 212 aa  92.4  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.17 
 
 		 212 aa  92.4  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.17 
 
 		 212 aa  92.4  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7739  hypothetical protein  34.21 
 
 		 220 aa  92  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1360  ParA family protein, putative  33.82 
 
 		 217 aa  92.4  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0573305  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.17 
 
 		 212 aa  92  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.69 
 
 		 212 aa  91.7  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.21 
 
 		 212 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1680  hypothetical protein  35.58 
 
 		 211 aa  91.7  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.679008  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.21 
 
 		 212 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1033  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.26 
 
 		 276 aa  91.3  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0985734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.69 
 
 		 212 aa  91.3  9e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  32.21 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.21 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.17 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.21 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.64 
 
 		 222 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.14 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1378  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.58 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.626674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.21 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0025  para protein  31.58 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00204905  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.73 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6252  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  33.33 
 
 		 223 aa  88.6  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0236598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.73 
 
 		 212 aa  88.6  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2658  hypothetical protein  32.39 
 
 		 195 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3446  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.39 
 
 		 195 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.02 
 
 		 232 aa  86.3  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  31.73 
 
 		 212 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.02 
 
 		 232 aa  86.3  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.5 
 
 		 216 aa  86.3  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.37 
 
 		 212 aa  85.5  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  33.01 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0129  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.7 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0003  partition protein  31.1 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000179256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5343  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.67 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2330  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.93 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3315  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.58 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3783  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.67 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0208258  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3896  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.67 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0821  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.16 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.051634 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6875  ATPases involved in chromosome partitioning-like protein  33.33 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  29.06 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.43 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5819  plasmid partitioning ATPase  28.23 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.81 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4151  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.06 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.81 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1305  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.81 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.153977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  29.86 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5598  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000000765743  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4881  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.5 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270203  hitchhiker  0.000435633 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4554  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.92 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.88 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>