More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTOA0014 on replicon NC_004633
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  100 
 
 		 209 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  72.12 
 
 		 209 aa  310  6.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  68.45 
 
 		 211 aa  289  2e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45 
 
 		 214 aa  180  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.66 
 
 		 222 aa  179  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  43.48 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.12 
 
 		 207 aa  171  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.5 
 
 		 209 aa  162  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.55 
 
 		 212 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.51 
 
 		 212 aa  157  8e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.44 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43 
 
 		 212 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.48 
 
 		 212 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.48 
 
 		 212 aa  149  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.48 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.51 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.51 
 
 		 212 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.51 
 
 		 212 aa  148  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.51 
 
 		 212 aa  148  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  43 
 
 		 212 aa  147  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.55 
 
 		 212 aa  145  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.55 
 
 		 212 aa  145  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.06 
 
 		 212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  42.03 
 
 		 212 aa  145  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.03 
 
 		 212 aa  144  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.55 
 
 		 212 aa  144  9e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.71 
 
 		 217 aa  144  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.55 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  41.06 
 
 		 212 aa  142  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.03 
 
 		 212 aa  141  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.75 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.55 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.63 
 
 		 212 aa  139  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  39.61 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.78 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.13 
 
 		 217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.71 
 
 		 217 aa  134  9e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.71 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2330  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.72 
 
 		 212 aa  132  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.04 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.13 
 
 		 217 aa  129  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.39 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.13 
 
 		 217 aa  129  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.97 
 
 		 217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1033  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.87 
 
 		 276 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0985734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.25 
 
 		 217 aa  124  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7432  putative partition protein  38.76 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.529714 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.35 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.27 
 
 		 220 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.27 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.94 
 
 		 212 aa  105  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  34.88 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.27 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.27 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33 
 
 		 224 aa  105  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.88 
 
 		 220 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.88 
 
 		 220 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4151  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.05 
 
 		 220 aa  105  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.8 
 
 		 231 aa  105  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.88 
 
 		 220 aa  105  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.8 
 
 		 231 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.8 
 
 		 231 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.8 
 
 		 231 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.8 
 
 		 231 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.8 
 
 		 231 aa  104  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.8 
 
 		 231 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  33.95 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2114  ParA family protein  34.11 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579771  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3176  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  34.11 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00741579  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1503  ParA family protein  34.11 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000197714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1422  ParA family protein  34.11 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000341933  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1906  plasmid partitioning-family protein  34.88 
 
 		 240 aa  100  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2409  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  34.11 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3289  ParA family protein  34.11 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000336314  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1143  ParA family protein  34.11 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661225  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  36.56 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0183  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.74 
 
 		 221 aa  97.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150447  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.42 
 
 		 241 aa  96.7  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.68 
 
 		 211 aa  95.9  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.15 
 
 		 211 aa  95.9  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1978  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.74 
 
 		 211 aa  95.1  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.37 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.73 
 
 		 216 aa  92.8  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.9 
 
 		 212 aa  92.4  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.87 
 
 		 232 aa  90.5  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.87 
 
 		 232 aa  90.5  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5120  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.31 
 
 		 217 aa  90.5  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5757  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.69 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.81 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5279  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.46 
 
 		 213 aa  89.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0009  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.01 
 
 		 211 aa  89  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.363565  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  30.99 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3124  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.81 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0597611 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.38 
 
 		 214 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5819  plasmid partitioning ATPase  30.66 
 
 		 218 aa  85.9  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  28.1 
 
 		 223 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3460  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.33 
 
 		 216 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  29.91 
 
 		 206 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5343  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.13 
 
 		 219 aa  85.1  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.43 
 
 		 232 aa  84.7  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>