More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3684 on replicon NC_010815
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010815  Glov_3684  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 		 216 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.444567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0001  putative partition protein  39.07 
 
 		 216 aa  155  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.91 
 
 		 213 aa  149  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000187977 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6541  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.62 
 
 		 221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.975947  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3600  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  40.19 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  34.39 
 
 		 228 aa  144  7.0000000000000006e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5389  hypothetical protein  39.15 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4960  hypothetical protein  39.15 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7043  hypothetical protein  41.71 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.284311  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4776  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.12 
 
 		 209 aa  142  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.74468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2401  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.03 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.51 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0226442  normal  0.408806 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7739  hypothetical protein  41.21 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  37.04 
 
 		 213 aa  131  6.999999999999999e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  33.79 
 
 		 222 aa  128  8.000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7009  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.88 
 
 		 223 aa  122  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.295052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1377  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.62 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.51 
 
 		 212 aa  115  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.1 
 
 		 222 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0021  hypothetical protein  33.49 
 
 		 227 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0145504  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 209 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.86 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.43 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1360  ParA family protein, putative  32.39 
 
 		 217 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0573305  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0025  para protein  32.54 
 
 		 222 aa  105  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00204905  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2879  hypothetical protein  29.95 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187633  hitchhiker  0.00000000100318 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2325  hypothetical protein  31.19 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.338387  normal  0.476496 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.54 
 
 		 214 aa  105  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1769  hypothetical protein  29.49 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.00507269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.65 
 
 		 212 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.18 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.32 
 
 		 217 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.6 
 
 		 212 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.24 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.66 
 
 		 210 aa  101  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.83 
 
 		 217 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.96 
 
 		 236 aa  100  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144706  hitchhiker  0.0000785935 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.02 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.02 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.54 
 
 		 210 aa  99  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.74 
 
 		 212 aa  99.4  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.81 
 
 		 213 aa  99  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.96 
 
 		 217 aa  98.6  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  31.78 
 
 		 207 aa  98.2  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  32.23 
 
 		 220 aa  96.3  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.66 
 
 		 217 aa  96.3  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03280  parA family protein  32.09 
 
 		 231 aa  95.5  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.49 
 
 		 212 aa  95.1  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.54 
 
 		 212 aa  94.7  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.54 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.8 
 
 		 212 aa  94.7  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 212 aa  94  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 212 aa  94.4  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 212 aa  94  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.79 
 
 		 212 aa  94.4  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.54 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 212 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.51 
 
 		 212 aa  94  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  33.33 
 
 		 212 aa  93.2  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6252  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  28.57 
 
 		 223 aa  92.8  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0236598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.08 
 
 		 212 aa  92.4  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2373  hypothetical protein  31.78 
 
 		 247 aa  92.8  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.714384  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.08 
 
 		 212 aa  92.4  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.08 
 
 		 212 aa  92.4  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1552  hypothetical protein  30.7 
 
 		 222 aa  92.4  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.86 
 
 		 212 aa  92  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2428  hypothetical protein  30.23 
 
 		 222 aa  92  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.138637  normal  0.0455143 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2498  hypothetical protein  30.23 
 
 		 222 aa  92  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.349306  normal  0.0447038 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  33.8 
 
 		 212 aa  92  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4248  chromosome partitioning ATPase  30.14 
 
 		 222 aa  91.7  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173583  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2808  hypothetical protein  30.23 
 
 		 222 aa  91.7  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1745  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.72 
 
 		 213 aa  91.3  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.543877  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2680  hypothetical protein  30.23 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0196753 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1662  hypothetical protein  30.23 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00377419  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.42 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1677  hypothetical protein  30.23 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.2 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.82 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1699  hypothetical protein  30.23 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.228644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2590  hypothetical protein  30.23 
 
 		 222 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.300803  normal  0.0153957 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.86 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2330  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.68 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.6 
 
 		 212 aa  89  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1680  hypothetical protein  33.8 
 
 		 211 aa  88.6  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.679008  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  32.39 
 
 		 212 aa  88.6  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1378  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.8 
 
 		 211 aa  88.2  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.626674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.8 
 
 		 211 aa  88.2  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.8 
 
 		 211 aa  88.2  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1295  hypothetical protein  29.91 
 
 		 247 aa  88.2  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3331  hypothetical protein  30.84 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1535  hypothetical protein  34 
 
 		 247 aa  86.7  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.295146 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1451  hypothetical protein  29.95 
 
 		 224 aa  86.7  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00188654  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1107  hypothetical protein  31.63 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0207  parA family protein  29.95 
 
 		 222 aa  86.3  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0008  plasmid partition protein A, putative  30.32 
 
 		 219 aa  86.3  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745248  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5819  plasmid partitioning ATPase  30.37 
 
 		 218 aa  86.3  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1281  hypothetical protein  33.33 
 
 		 247 aa  85.5  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1285  hypothetical protein  30.41 
 
 		 222 aa  85.1  8e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.016663 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6875  ATPases involved in chromosome partitioning-like protein  28.12 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>