More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7732 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  100 
 
 
220 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  84.36 
 
 
212 aa  357  9.999999999999999e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  83.89 
 
 
217 aa  352  2.9999999999999997e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  83.41 
 
 
217 aa  348  3e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  82.86 
 
 
217 aa  348  3e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  82.46 
 
 
212 aa  346  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  82.46 
 
 
212 aa  342  4e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  84.83 
 
 
212 aa  340  1e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  80 
 
 
217 aa  336  9.999999999999999e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  80.95 
 
 
217 aa  335  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  83.41 
 
 
212 aa  335  2.9999999999999997e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  83.81 
 
 
217 aa  330  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  79.52 
 
 
217 aa  328  3e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  79.52 
 
 
217 aa  328  3e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  82.13 
 
 
217 aa  325  3e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7432  putative partition protein  77.25 
 
 
212 aa  305  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.529714 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1033  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  76.33 
 
 
276 aa  289  2e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0985734  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  62.2 
 
 
212 aa  255  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.16 
 
 
212 aa  255  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  63.16 
 
 
212 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  64.11 
 
 
212 aa  242  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  62.68 
 
 
212 aa  241  7e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.16 
 
 
212 aa  241  7e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.16 
 
 
212 aa  240  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.16 
 
 
212 aa  239  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  62.2 
 
 
212 aa  239  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  63.64 
 
 
212 aa  239  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  62.2 
 
 
212 aa  240  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.64 
 
 
212 aa  239  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.64 
 
 
212 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.68 
 
 
212 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.2 
 
 
212 aa  237  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.16 
 
 
212 aa  237  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.16 
 
 
212 aa  236  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.72 
 
 
212 aa  235  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.77 
 
 
212 aa  235  5.0000000000000005e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  59.81 
 
 
212 aa  229  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2330  cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.82 
 
 
212 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.96 
 
 
252 aa  215  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  49.28 
 
 
207 aa  209  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.48 
 
 
207 aa  205  5e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.1 
 
 
214 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.76 
 
 
222 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.72 
 
 
209 aa  191  7e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.92 
 
 
209 aa  150  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.42 
 
 
211 aa  142  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  39.61 
 
 
209 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.57 
 
 
224 aa  128  8.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.9 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5343  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.68 
 
 
219 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  36.11 
 
 
220 aa  122  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.11 
 
 
220 aa  121  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.11 
 
 
220 aa  121  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.11 
 
 
220 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.11 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.11 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.11 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.11 
 
 
220 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.18 
 
 
211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5819  plasmid partitioning ATPase  36.79 
 
 
218 aa  118  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3289  ParA family protein  36.11 
 
 
220 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000336314  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2114  ParA family protein  36.11 
 
 
220 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579771  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1143  ParA family protein  36.11 
 
 
220 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661225  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3176  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  36.11 
 
 
220 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00741579  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1503  ParA family protein  36.11 
 
 
220 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000197714  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2409  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  36.11 
 
 
220 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1422  ParA family protein  36.11 
 
 
220 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000341933  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.79 
 
 
220 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0003  partition protein  38.71 
 
 
222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000179256  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3783  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.6 
 
 
222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0208258  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4151  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.25 
 
 
220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3896  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.6 
 
 
222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  33.33 
 
 
220 aa  115  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.62 
 
 
210 aa  114  7.999999999999999e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.86 
 
 
212 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  36.62 
 
 
212 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4776  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.49 
 
 
209 aa  100  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.74468  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.99 
 
 
216 aa  99.8  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  31.5 
 
 
228 aa  98.6  6e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1680  hypothetical protein  39.15 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.679008  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.87 
 
 
211 aa  96.7  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3684  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.23 
 
 
216 aa  96.3  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.444567  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1378  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.15 
 
 
211 aa  96.7  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.626674  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  36.02 
 
 
211 aa  96.3  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1377  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.71 
 
 
211 aa  93.6  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1978  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.78 
 
 
211 aa  93.2  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0183  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.49 
 
 
221 aa  92.8  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150447  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5082  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.52 
 
 
227 aa  89.4  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.161986 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5279  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.28 
 
 
213 aa  89  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.48 
 
 
213 aa  88.6  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.8 
 
 
231 aa  88.6  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.8 
 
 
231 aa  88.6  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.8 
 
 
231 aa  88.6  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  34.1 
 
 
213 aa  88.2  8e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0047  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.95 
 
 
209 aa  87.8  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7009  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.8 
 
 
223 aa  87.8  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.295052  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.18 
 
 
231 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  27.91 
 
 
206 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0129  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.5 
 
 
217 aa  87.4  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.18 
 
 
231 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.743833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>