More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1033 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1033  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
276 aa  545  1e-154  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0985734  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  76.81 
 
 
212 aa  314  8e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  77.29 
 
 
217 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  76.33 
 
 
220 aa  311  7.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  74.76 
 
 
217 aa  307  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  74.76 
 
 
212 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  73.81 
 
 
217 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  74.88 
 
 
212 aa  301  6.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  77.37 
 
 
212 aa  301  9e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  73.81 
 
 
217 aa  299  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  69.81 
 
 
217 aa  294  9e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  77.37 
 
 
217 aa  294  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  72.95 
 
 
217 aa  293  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  72.95 
 
 
217 aa  293  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  75.26 
 
 
212 aa  291  6e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  75.26 
 
 
217 aa  291  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7432  putative partition protein  72.38 
 
 
212 aa  276  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.529714 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.9 
 
 
212 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.45 
 
 
212 aa  241  9e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60 
 
 
212 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.88 
 
 
212 aa  229  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.35 
 
 
212 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.9 
 
 
212 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  59.35 
 
 
212 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.87 
 
 
212 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.39 
 
 
212 aa  224  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.39 
 
 
212 aa  224  8e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.42 
 
 
212 aa  224  9e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.41 
 
 
212 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.94 
 
 
212 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.97 
 
 
212 aa  223  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.97 
 
 
212 aa  223  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.94 
 
 
212 aa  222  4e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  57.97 
 
 
212 aa  222  6e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.49 
 
 
212 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.42 
 
 
212 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  57.49 
 
 
212 aa  218  6e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.83 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2330  cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.85 
 
 
212 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  48.31 
 
 
207 aa  199  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.83 
 
 
207 aa  195  7e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.52 
 
 
209 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.28 
 
 
214 aa  192  6e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.79 
 
 
222 aa  186  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.5 
 
 
209 aa  151  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  40.87 
 
 
209 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.23 
 
 
211 aa  133  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  35.02 
 
 
220 aa  122  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.2 
 
 
224 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.02 
 
 
220 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.9 
 
 
212 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.56 
 
 
220 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.56 
 
 
220 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.56 
 
 
220 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.56 
 
 
220 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.56 
 
 
220 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.21 
 
 
220 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2114  ParA family protein  34.56 
 
 
220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579771  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2409  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  34.56 
 
 
220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1422  ParA family protein  34.56 
 
 
220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000341933  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1503  ParA family protein  34.56 
 
 
220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000197714  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3289  ParA family protein  34.56 
 
 
220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000336314  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1143  ParA family protein  34.56 
 
 
220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661225  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3176  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  34.56 
 
 
220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00741579  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.72 
 
 
220 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  32.72 
 
 
220 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5343  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.21 
 
 
219 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4151  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.64 
 
 
220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5819  plasmid partitioning ATPase  35.81 
 
 
218 aa  108  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.42 
 
 
211 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.1 
 
 
210 aa  105  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.02 
 
 
216 aa  97.4  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5279  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.56 
 
 
213 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.5 
 
 
213 aa  96.3  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000187977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1680  hypothetical protein  42.08 
 
 
211 aa  95.9  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.679008  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  33.12 
 
 
228 aa  95.5  7e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.84 
 
 
212 aa  95.5  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1378  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.08 
 
 
211 aa  95.5  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.626674  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  36.97 
 
 
211 aa  95.1  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0183  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.92 
 
 
221 aa  95.1  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150447  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2401  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.68 
 
 
213 aa  94.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266448  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0001  putative partition protein  40.56 
 
 
216 aa  93.6  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3896  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.49 
 
 
222 aa  93.6  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3783  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.49 
 
 
222 aa  93.6  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0208258  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4776  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.26 
 
 
209 aa  93.6  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.74468  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0003  partition protein  33.65 
 
 
222 aa  93.2  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000179256  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3684  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.92 
 
 
216 aa  93.2  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.444567  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.24 
 
 
231 aa  90.5  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.24 
 
 
231 aa  90.1  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.95 
 
 
210 aa  90.5  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.24 
 
 
231 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.24 
 
 
231 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.11 
 
 
211 aa  89.7  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.24 
 
 
231 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.24 
 
 
231 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.29 
 
 
234 aa  89  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.24 
 
 
231 aa  89  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  36.08 
 
 
212 aa  88.6  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1978  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.63 
 
 
211 aa  88.2  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.27 
 
 
241 aa  87.4  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>