More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6670 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
231 aa  477  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  99.57 
 
 
231 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  99.57 
 
 
231 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  98.7 
 
 
231 aa  471  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  98.7 
 
 
231 aa  471  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  98.7 
 
 
231 aa  470  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  98.7 
 
 
231 aa  471  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.95 
 
 
232 aa  312  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.95 
 
 
232 aa  312  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.47 
 
 
220 aa  149  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  40 
 
 
220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.04 
 
 
220 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  37.04 
 
 
220 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.07 
 
 
220 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4151  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.96 
 
 
220 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.07 
 
 
220 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.53 
 
 
220 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.53 
 
 
220 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.53 
 
 
220 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3289  ParA family protein  39.53 
 
 
220 aa  141  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000336314  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2114  ParA family protein  39.53 
 
 
220 aa  141  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579771  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1143  ParA family protein  39.53 
 
 
220 aa  141  8e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661225  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3176  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  39.53 
 
 
220 aa  141  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00741579  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1503  ParA family protein  39.53 
 
 
220 aa  141  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000197714  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2409  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  39.53 
 
 
220 aa  141  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1422  ParA family protein  39.53 
 
 
220 aa  141  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000341933  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.07 
 
 
220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5082  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.5 
 
 
227 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.161986 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3896  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.53 
 
 
222 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3783  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.53 
 
 
222 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0208258  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5343  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.71 
 
 
219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0003  partition protein  34.38 
 
 
222 aa  128  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000179256  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5819  plasmid partitioning ATPase  34.08 
 
 
218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.35 
 
 
212 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.44 
 
 
216 aa  119  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.71 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0183  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.57 
 
 
221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150447  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.38 
 
 
211 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  33.8 
 
 
209 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  31.44 
 
 
212 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1978  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.77 
 
 
211 aa  99.8  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.44 
 
 
222 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.77 
 
 
211 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  28.57 
 
 
207 aa  99.4  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.84 
 
 
217 aa  97.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.45 
 
 
209 aa  96.7  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.18 
 
 
209 aa  95.9  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1953  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.98 
 
 
187 aa  95.5  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1378  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.71 
 
 
211 aa  94.4  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.626674  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.41 
 
 
212 aa  94  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32 
 
 
217 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.87 
 
 
217 aa  93.2  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1680  hypothetical protein  32.24 
 
 
211 aa  93.2  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.679008  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  30.22 
 
 
228 aa  92.8  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.24 
 
 
217 aa  92  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.6 
 
 
214 aa  91.7  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0391  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.48 
 
 
264 aa  91.7  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000118454  unclonable  0.000000000458103 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4271  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.17 
 
 
229 aa  91.3  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.323978  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.26 
 
 
217 aa  90.9  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.26 
 
 
217 aa  90.1  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.26 
 
 
217 aa  90.1  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.18 
 
 
212 aa  89.7  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.03 
 
 
211 aa  89  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.18 
 
 
217 aa  88.6  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  32.8 
 
 
220 aa  88.6  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.49 
 
 
212 aa  87.8  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 
212 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.26 
 
 
217 aa  85.9  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.91 
 
 
212 aa  85.9  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.58 
 
 
212 aa  85.5  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.17 
 
 
207 aa  85.5  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.27 
 
 
212 aa  85.5  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.73 
 
 
211 aa  84.3  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.73 
 
 
211 aa  84.3  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.22 
 
 
251 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  33.33 
 
 
211 aa  84.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.11 
 
 
212 aa  84.7  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3684  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.3 
 
 
216 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.444567  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.37 
 
 
212 aa  84  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02473  hypothetical protein  28.11 
 
 
222 aa  84  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  30.45 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0009  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.363565  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  27.93 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.58 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.56 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.91 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.08 
 
 
212 aa  82  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.58 
 
 
212 aa  82  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.45 
 
 
212 aa  82  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.91 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  31.58 
 
 
212 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.05 
 
 
212 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.58 
 
 
212 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.72 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1008  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.7 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2330  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.58 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.05 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0431  partition protein  30 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.28 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.572043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>