More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2621 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 		 212 aa  411  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  99.06 
 
 		 212 aa  408  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  99.06 
 
 		 212 aa  408  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  96.7 
 
 		 212 aa  402  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  94.81 
 
 		 212 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  97.17 
 
 		 212 aa  382  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  95.75 
 
 		 212 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  96.23 
 
 		 212 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  96.23 
 
 		 212 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  93.4 
 
 		 212 aa  374  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  94.81 
 
 		 212 aa  374  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  93.87 
 
 		 212 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  93.4 
 
 		 212 aa  371  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  95.24 
 
 		 212 aa  372  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  93.4 
 
 		 212 aa  372  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  94.81 
 
 		 212 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  92.45 
 
 		 212 aa  367  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  91.04 
 
 		 212 aa  361  4e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  90.95 
 
 		 212 aa  359  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  90.52 
 
 		 212 aa  356  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2330  cobyrinic acid ac-diamide synthase  92.92 
 
 		 212 aa  349  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  68.1 
 
 		 217 aa  274  6e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  76.96 
 
 		 252 aa  270  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  65.07 
 
 		 217 aa  262  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  66.03 
 
 		 217 aa  261  4e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  66.03 
 
 		 217 aa  261  4e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  65.55 
 
 		 212 aa  261  4e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.64 
 
 		 212 aa  260  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  67.01 
 
 		 212 aa  258  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  64.08 
 
 		 212 aa  254  7e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  63.16 
 
 		 220 aa  254  9e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.29 
 
 		 217 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.29 
 
 		 217 aa  252  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  64.73 
 
 		 217 aa  252  4.0000000000000004e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  65.61 
 
 		 217 aa  247  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  65.09 
 
 		 217 aa  246  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  64.43 
 
 		 212 aa  244  4.9999999999999997e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7432  putative partition protein  64.59 
 
 		 212 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.529714 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1033  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.87 
 
 		 276 aa  226  3e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0985734  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  51.67 
 
 		 207 aa  225  4e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.95 
 
 		 207 aa  221  4.9999999999999996e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.72 
 
 		 214 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.72 
 
 		 222 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.08 
 
 		 209 aa  207  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.44 
 
 		 209 aa  165  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  43.48 
 
 		 209 aa  161  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.87 
 
 		 211 aa  160  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.48 
 
 		 224 aa  149  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.58 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  34.11 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.58 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.36 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.58 
 
 		 220 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.58 
 
 		 220 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.58 
 
 		 220 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.58 
 
 		 220 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.11 
 
 		 220 aa  117  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4151  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.74 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3289  ParA family protein  33.64 
 
 		 220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000336314  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2409  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  33.64 
 
 		 220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2114  ParA family protein  33.64 
 
 		 220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579771  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1503  ParA family protein  33.64 
 
 		 220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000197714  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3176  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  33.64 
 
 		 220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00741579  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1143  ParA family protein  33.64 
 
 		 220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661225  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1422  ParA family protein  33.64 
 
 		 220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000341933  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.57 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5343  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.45 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5819  plasmid partitioning ATPase  36.45 
 
 		 218 aa  113  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  32.86 
 
 		 220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.68 
 
 		 210 aa  111  8.000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.39 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3896  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.45 
 
 		 222 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3783  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.45 
 
 		 222 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0208258  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3684  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.08 
 
 		 216 aa  105  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.444567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  41.24 
 
 		 212 aa  105  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.74 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000187977 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.15 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0003  partition protein  35.98 
 
 		 222 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000179256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1680  hypothetical protein  38.5 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.679008  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1378  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.5 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.626674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  35.35 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1377  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.42 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5279  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.08 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0001  putative partition protein  33.33 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  35.71 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  28.85 
 
 		 206 aa  99  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7009  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.09 
 
 		 223 aa  98.6  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.295052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.02 
 
 		 211 aa  98.6  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  36.11 
 
 		 228 aa  98.2  9e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0047  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.71 
 
 		 209 aa  97.4  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1978  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.38 
 
 		 211 aa  97.4  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.1 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.1 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0183  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.39 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150447  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2401  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.21 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1360  ParA family protein, putative  35.38 
 
 		 217 aa  94.7  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0573305  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1906  plasmid partitioning-family protein  36.54 
 
 		 240 aa  94.4  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5757  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.32 
 
 		 215 aa  94  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.5 
 
 		 241 aa  93.2  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>