More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0610 on replicon NC_009795
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  454  1e-127  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  50 
 
 		 222 aa  206  3e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0025  para protein  44.71 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00204905  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3684  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.39 
 
 		 216 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.444567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.19 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0226442  normal  0.408806 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5389  hypothetical protein  32.43 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  35.78 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4960  hypothetical protein  32.43 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.25 
 
 		 210 aa  115  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.58 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.91 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.84 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2401  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.45 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.5 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000187977 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.98 
 
 		 217 aa  106  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4776  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.74468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.98 
 
 		 217 aa  106  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.24 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.04 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.83 
 
 		 217 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.01 
 
 		 217 aa  105  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3600  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  29.28 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.02 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.88 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.2 
 
 		 217 aa  102  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.34 
 
 		 217 aa  101  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.71 
 
 		 217 aa  101  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.06 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2879  hypothetical protein  28.63 
 
 		 222 aa  100  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187633  hitchhiker  0.00000000100318 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.27 
 
 		 210 aa  99.4  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.29 
 
 		 212 aa  99.4  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.14 
 
 		 213 aa  99  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  30.48 
 
 		 207 aa  98.6  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2325  hypothetical protein  26.99 
 
 		 222 aa  98.6  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.338387  normal  0.476496 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.5 
 
 		 217 aa  98.6  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  31.5 
 
 		 220 aa  98.6  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1769  hypothetical protein  30.48 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.00507269 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.42 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1360  ParA family protein, putative  36.57 
 
 		 217 aa  96.3  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0573305  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.42 
 
 		 212 aa  96.7  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.54 
 
 		 212 aa  96.3  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.45 
 
 		 212 aa  95.9  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0001  putative partition protein  31.97 
 
 		 216 aa  95.9  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.19 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1377  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.27 
 
 		 211 aa  92.4  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.22 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.29 
 
 		 209 aa  92.8  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.22 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.22 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.14 
 
 		 212 aa  92.4  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.22 
 
 		 231 aa  92  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.22 
 
 		 231 aa  92  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.22 
 
 		 231 aa  92  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6541  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.44 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.975947  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.22 
 
 		 231 aa  91.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.11 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.71 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.25 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.67 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.14 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.11 
 
 		 212 aa  89.4  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.11 
 
 		 212 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.64 
 
 		 212 aa  89.7  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.95 
 
 		 232 aa  89.4  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5043  hypothetical protein  29.96 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000269108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.67 
 
 		 212 aa  89.7  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7009  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.79 
 
 		 223 aa  89.7  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.295052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.95 
 
 		 232 aa  89.4  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  36.11 
 
 		 212 aa  89  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.62 
 
 		 212 aa  88.6  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.19 
 
 		 212 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.11 
 
 		 212 aa  88.6  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.11 
 
 		 212 aa  88.6  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.11 
 
 		 212 aa  88.6  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  30.69 
 
 		 212 aa  88.2  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6252  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  28.51 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0236598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2431  hypothetical protein  30.17 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.44122  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0021  hypothetical protein  23.98 
 
 		 227 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0145504  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  36.11 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2330  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.42 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1285  hypothetical protein  28.76 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.016663 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.63 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.72 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2590  hypothetical protein  29.65 
 
 		 222 aa  86.3  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.300803  normal  0.0153957 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7043  hypothetical protein  25.48 
 
 		 227 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.284311  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.36 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1451  hypothetical protein  26.54 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00188654  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2428  hypothetical protein  29.2 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.138637  normal  0.0455143 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2498  hypothetical protein  29.2 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.349306  normal  0.0447038 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1033  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.12 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0985734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7432  putative partition protein  33.12 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.529714 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1662  hypothetical protein  30.09 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00377419  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1699  hypothetical protein  30.09 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.228644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2680  hypothetical protein  30.09 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0196753 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1677  hypothetical protein  30.09 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4151  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.05 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1552  hypothetical protein  29.65 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.56 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144706  hitchhiker  0.0000785935 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2808  hypothetical protein  28.32 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7739  hypothetical protein  31.78 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>