More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3861 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 		 214 aa  432  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  75.98 
 
 		 222 aa  317  7.999999999999999e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  62.75 
 
 		 207 aa  270  1e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.33 
 
 		 207 aa  259  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  62.43 
 
 		 209 aa  259  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.47 
 
 		 212 aa  214  8e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.53 
 
 		 212 aa  211  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.39 
 
 		 217 aa  209  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.37 
 
 		 217 aa  209  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.42 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  51.89 
 
 		 212 aa  205  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.52 
 
 		 212 aa  205  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.94 
 
 		 212 aa  204  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.69 
 
 		 212 aa  204  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.91 
 
 		 217 aa  204  9e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.69 
 
 		 212 aa  203  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.42 
 
 		 212 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.94 
 
 		 212 aa  202  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.94 
 
 		 212 aa  202  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.91 
 
 		 217 aa  202  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.26 
 
 		 217 aa  202  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.21 
 
 		 212 aa  201  6e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.24 
 
 		 212 aa  201  9e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.21 
 
 		 212 aa  200  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.05 
 
 		 212 aa  200  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.21 
 
 		 212 aa  200  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  48.1 
 
 		 220 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.53 
 
 		 212 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  50.47 
 
 		 212 aa  199  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.72 
 
 		 212 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.72 
 
 		 212 aa  198  5e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.24 
 
 		 212 aa  197  9e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.51 
 
 		 212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.54 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.22 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.22 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.32 
 
 		 217 aa  194  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  49.53 
 
 		 212 aa  194  9e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.32 
 
 		 217 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.32 
 
 		 212 aa  188  5e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7432  putative partition protein  49.02 
 
 		 212 aa  188  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.529714 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.34 
 
 		 209 aa  185  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2330  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.48 
 
 		 212 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  45 
 
 		 209 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.97 
 
 		 211 aa  178  4.999999999999999e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1033  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.28 
 
 		 276 aa  177  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0985734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.22 
 
 		 252 aa  176  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.2 
 
 		 224 aa  152  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.06 
 
 		 211 aa  128  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.42 
 
 		 220 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.42 
 
 		 220 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.42 
 
 		 220 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.42 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.42 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  35.42 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  34.9 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.42 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.42 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.42 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.13 
 
 		 212 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4151  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.49 
 
 		 220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2114  ParA family protein  34.42 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579771  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3289  ParA family protein  34.42 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000336314  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1503  ParA family protein  34.42 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000197714  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3176  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  34.42 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00741579  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1422  ParA family protein  34.42 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000341933  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1143  ParA family protein  34.42 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661225  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2409  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  34.42 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.47 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  35.41 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.1 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0183  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.04 
 
 		 221 aa  112  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150447  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.79 
 
 		 213 aa  111  9e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000187977 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0001  putative partition protein  37.09 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7009  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.3 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.295052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2401  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.74 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  35.24 
 
 		 211 aa  108  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  34.04 
 
 		 228 aa  106  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  36.76 
 
 		 212 aa  105  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0047  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.81 
 
 		 209 aa  105  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3684  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.54 
 
 		 216 aa  105  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.444567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.07 
 
 		 211 aa  105  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1978  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.06 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  33.64 
 
 		 222 aa  101  7e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1360  ParA family protein, putative  39.06 
 
 		 217 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0573305  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5819  plasmid partitioning ATPase  33.33 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.48 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5343  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.28 
 
 		 219 aa  96.7  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1378  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.87 
 
 		 211 aa  96.3  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.626674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1680  hypothetical protein  35.87 
 
 		 211 aa  95.5  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.679008  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.62 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 213 aa  94  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.12 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.12 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.12 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.12 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.86 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.47 
 
 		 211 aa  92  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.47 
 
 		 211 aa  92  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0025  para protein  31.05 
 
 		 222 aa  92  6e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00204905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>