More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4248 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008757  Pnap_4248  chromosome partitioning ATPase  100 
 
 
222 aa  456  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173583  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6252  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  76.58 
 
 
223 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0236598  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6875  ATPases involved in chromosome partitioning-like protein  74.55 
 
 
223 aa  334  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4285  chromosome partitioning ATPase protein-like  29.6 
 
 
229 aa  123  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5043  hypothetical protein  33.33 
 
 
229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000269108  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4960  hypothetical protein  32.87 
 
 
213 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5389  hypothetical protein  32.87 
 
 
213 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3684  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.14 
 
 
216 aa  96.3  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.444567  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.49 
 
 
213 aa  88.6  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000187977 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  29.36 
 
 
213 aa  86.3  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.9 
 
 
222 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.3 
 
 
217 aa  85.5  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.3 
 
 
217 aa  85.5  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  29.52 
 
 
222 aa  85.1  8e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  29.39 
 
 
228 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.63 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.9 
 
 
207 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2325  hypothetical protein  27.06 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.338387  normal  0.476496 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.02 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2401  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.31 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266448  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  26.27 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.69 
 
 
232 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1377  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.22 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.69 
 
 
232 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.48 
 
 
217 aa  79  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1769  hypothetical protein  27.98 
 
 
222 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.00507269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.36 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.09 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.91 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3553  hypothetical protein  28.97 
 
 
217 aa  76.6  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.65 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.3 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.11 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.28 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2879  hypothetical protein  26.61 
 
 
222 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187633  hitchhiker  0.00000000100318 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.32 
 
 
217 aa  75.1  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.98 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2127  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.88 
 
 
238 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.02 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5587  hypothetical protein  28.04 
 
 
217 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.895248  normal  0.0278536 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.86 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.51 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.65 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.77 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  27.98 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.05 
 
 
215 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0226442  normal  0.408806 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.06 
 
 
209 aa  72  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  28.96 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.16 
 
 
217 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.86 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.41 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.86 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.86 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.43 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.41 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.41 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.96 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.86 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.41 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.96 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 
236 aa  70.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144706  hitchhiker  0.0000785935 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.51 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.99 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.86 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6491  ParA protein, putative  28.31 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.99 
 
 
231 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.99 
 
 
231 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.59 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.99 
 
 
231 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.99 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  28.05 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.99 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  28.12 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3600  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  25.81 
 
 
219 aa  68.6  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.44 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.05 
 
 
212 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0108  hypothetical protein  25.7 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.327497  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0025  para protein  25.66 
 
 
222 aa  67  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00204905  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2816  plasmid partition protein ParA-like  25.35 
 
 
210 aa  67  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.284483  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.33 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.7 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.84 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2330  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.78 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1285  hypothetical protein  29.36 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.016663 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.84 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2630  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.96 
 
 
232 aa  65.5  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7009  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.64 
 
 
223 aa  65.1  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.295052  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2777  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.02 
 
 
220 aa  65.1  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.84936 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.46 
 
 
213 aa  64.3  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.572043  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.9 
 
 
210 aa  63.9  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.91 
 
 
224 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3356  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.02 
 
 
211 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.73 
 
 
234 aa  63.2  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.503731  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0850  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.02 
 
 
219 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.668174  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2359  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.02 
 
 
219 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723291  normal  0.455428 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  25.34 
 
 
223 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0431  partition protein  32.31 
 
 
213 aa  63.2  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  26.98 
 
 
220 aa  62.8  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5598  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.07 
 
 
192 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000000765743  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1033  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.44 
 
 
276 aa  62.8  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0985734  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>