More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2127 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2127  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 		 238 aa  477  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2890  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.61 
 
 		 237 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2630  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  64.84 
 
 		 232 aa  305  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2944  ParA chromosome partitioning protein  65.91 
 
 		 238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4303  chromosome partitioning protein  54.55 
 
 		 252 aa  247  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5433  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.2 
 
 		 228 aa  185  7e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3579  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  39.37 
 
 		 227 aa  155  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.299225  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0061  parA protein, putative  36.49 
 
 		 228 aa  141  9e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0653211  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4687  ParA protein, putative  36.04 
 
 		 228 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4349  ParA protein, putative  36.04 
 
 		 228 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.108838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2810  ParA protein, putative  37.38 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0568831  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0704  chromosome partitioning protein  34.96 
 
 		 224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0283  putative partition protein ParA  32.56 
 
 		 228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8771  chromosome partitioning ATPase  37.16 
 
 		 226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5170  ParA protein, putative  27.13 
 
 		 260 aa  105  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.433255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6491  ParA protein, putative  33.51 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4164  hypothetical protein  30.3 
 
 		 233 aa  89  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0393565  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  29.9 
 
 		 206 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.5 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4271  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.7 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.323978  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.61 
 
 		 232 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.61 
 
 		 232 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.71 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.3 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9806  chromosome partitioning protein  31.2 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4551  hypothetical protein  28.76 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6380  hypothetical protein  29.33 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.76 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.94 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.88 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.88 
 
 		 231 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.88 
 
 		 231 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.88 
 
 		 231 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.88 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.26 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.32 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.43 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.88 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.43 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0391  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.8 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000118454  unclonable  0.000000000458103 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  28.32 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.76 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.46 
 
 		 215 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.76 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  33.69 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.6 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.16 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.31 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4248  chromosome partitioning ATPase  32.88 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.02 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4261  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.89 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  30.45 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.26 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.87 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.11 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.22 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4111  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.23 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000253608  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.79 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5598  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.51 
 
 		 192 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000000765743  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1033  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.19 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0985734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.77 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7432  putative partition protein  31.67 
 
 		 212 aa  67  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.529714 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1550  putative partition-related protein  30.73 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131235 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1875  ParA-like protein  30.73 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.06 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.503731  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8214  putative crown gall tumor protein VirC1  28.72 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144693  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  27.92 
 
 		 222 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1916  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.14 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374804  hitchhiker  0.00135404 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5587  hypothetical protein  29.1 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.895248  normal  0.0278536 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.77 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.33 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.33 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1925  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.14 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  27.84 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.28 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  32.35 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.34 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0025  para protein  25.52 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00204905  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.72 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.79 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.86 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.95 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5278  stability/partitioning determinant  26.07 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.918296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4668  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.01 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016966  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  26.53 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6252  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  28.27 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0236598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4776  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.48 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.74468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.36 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.89 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3553  hypothetical protein  28.44 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  29.69 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.72 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0431  partition protein  31.1 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6875  ATPases involved in chromosome partitioning-like protein  28.8 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.28 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.26 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  26.48 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.8 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>