More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0532 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
234 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.503731  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  85.84 
 
 
219 aa  378  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.09 
 
 
215 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.98 
 
 
232 aa  100  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.47 
 
 
222 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0681  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.13 
 
 
215 aa  91.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.94 
 
 
214 aa  90.9  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
217 aa  89.7  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
217 aa  89.7  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.18 
 
 
211 aa  89  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.18 
 
 
211 aa  89  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.64 
 
 
217 aa  87.4  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.96 
 
 
217 aa  87.4  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.21 
 
 
217 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.65 
 
 
212 aa  86.3  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1978  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.9 
 
 
211 aa  85.1  9e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  29.91 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0183  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.93 
 
 
221 aa  82  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150447  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.72 
 
 
231 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.24 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  35.12 
 
 
212 aa  81.6  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.16 
 
 
209 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  32.2 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.36 
 
 
207 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.25 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.55 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.11 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.34 
 
 
217 aa  80.9  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.02 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.25 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.25 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.25 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.69 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.69 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.02 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  28.11 
 
 
228 aa  78.2  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.14 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  30.81 
 
 
201 aa  77  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  31.1 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5343  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.19 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.05 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.34 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.38 
 
 
209 aa  75.5  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.55 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5819  plasmid partitioning ATPase  29.25 
 
 
218 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.1 
 
 
215 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.22 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2068  putative partition-related protein  32.65 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.22 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.22 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.22 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.92 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2477  conjugal plasmid transfer ATPase  27.76 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.826967  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3460  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.14 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  29.44 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.93 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.51 
 
 
212 aa  72  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4151  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.18 
 
 
220 aa  72  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.71 
 
 
232 aa  72  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.71 
 
 
232 aa  72  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2449  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.59 
 
 
219 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0538918  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.59 
 
 
219 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2444  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.59 
 
 
219 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1626  ParA family protein  31.14 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00224937  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0699  ParA family protein  31.14 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1202  ParA family protein  31.14 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0846  ParA family protein  31.14 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.89485  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2973  ParA family protein  31.14 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510642  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1047  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  31.14 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.4276  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.93 
 
 
220 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.93 
 
 
220 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2314  ParA family protein  31.14 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0184356  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2127  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.06 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1041  ParA family protein  31.14 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2359  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.34 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723291  normal  0.455428 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.93 
 
 
220 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1143  ParA family protein  28.31 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661225  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0047  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.04 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2114  ParA family protein  28.31 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579771  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0850  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.34 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.668174  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3289  ParA family protein  28.31 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000336314  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1503  ParA family protein  28.31 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000197714  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5775  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.34 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  28.43 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2220  ParA family partition protein  32.55 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  31.05 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3896  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.48 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3783  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.48 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0208258  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2491  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 
219 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.926396  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1422  ParA family protein  28.31 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000341933  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3176  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  28.31 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00741579  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2409  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  28.31 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.77 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.84 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.81 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.19 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0391  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.25 
 
 
264 aa  69.7  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000118454  unclonable  0.000000000458103 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1305  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.18 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.153977  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.18 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>