More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6491 on replicon NC_010502
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010502  Mrad2831_6491  ParA protein, putative  100 
 
 
219 aa  442  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8771  chromosome partitioning ATPase  37.9 
 
 
226 aa  129  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0061  parA protein, putative  37.2 
 
 
228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0653211  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4687  ParA protein, putative  36.71 
 
 
228 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4349  ParA protein, putative  36.71 
 
 
228 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.108838  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3579  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  35.87 
 
 
227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.299225  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0283  putative partition protein ParA  37.14 
 
 
228 aa  126  3e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2810  ParA protein, putative  36.23 
 
 
231 aa  126  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0568831  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0704  chromosome partitioning protein  33.48 
 
 
224 aa  124  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5433  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.09 
 
 
228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2127  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.51 
 
 
238 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2630  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.04 
 
 
232 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2890  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.04 
 
 
237 aa  98.6  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5170  ParA protein, putative  29.03 
 
 
260 aa  95.1  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.433255  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4303  chromosome partitioning protein  33.01 
 
 
252 aa  86.3  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2944  ParA chromosome partitioning protein  32.45 
 
 
238 aa  84  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 
212 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8214  putative crown gall tumor protein VirC1  30.73 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144693  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5278  stability/partitioning determinant  30.85 
 
 
228 aa  78.6  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.918296  normal 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  31.46 
 
 
206 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6252  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  29.65 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0236598  normal 
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0025  para protein  30.09 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00204905  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5598  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.75 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000000765743  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  27.4 
 
 
222 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.84 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4271  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.38 
 
 
229 aa  72.8  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.323978  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.27 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 
219 aa  72.4  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.858877  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4164  hypothetical protein  28.88 
 
 
233 aa  72.4  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0393565  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.65 
 
 
232 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.17 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3304  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.93 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.65 
 
 
232 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.2 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6875  ATPases involved in chromosome partitioning-like protein  29.28 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.3 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.85 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.5 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  28.72 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.27 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.05 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  26.44 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6419  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.16 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.997176 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.43 
 
 
242 aa  68.2  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.37688  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.84 
 
 
222 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6380  hypothetical protein  27.27 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4248  chromosome partitioning ATPase  28.77 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173583  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.03 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4261  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.37 
 
 
193 aa  65.5  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.71 
 
 
234 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.503731  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.98 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.05 
 
 
216 aa  64.3  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.59 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  26.01 
 
 
228 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.05 
 
 
217 aa  64.3  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.33 
 
 
234 aa  64.3  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4551  hypothetical protein  26.15 
 
 
237 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.13 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.49 
 
 
212 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.25 
 
 
219 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.1 
 
 
212 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0098  partition protein  28.24 
 
 
209 aa  63.2  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10243  normal  0.0389744 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  24.06 
 
 
209 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.37 
 
 
229 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.5 
 
 
212 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.27 
 
 
217 aa  63.5  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.37 
 
 
229 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.37 
 
 
229 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.44 
 
 
217 aa  62.4  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3315  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.81 
 
 
223 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.37 
 
 
212 aa  62.4  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.81 
 
 
209 aa  62.4  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5587  hypothetical protein  27.88 
 
 
217 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.895248  normal  0.0278536 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.09 
 
 
212 aa  62  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4139  partition parA like-protein  27.41 
 
 
241 aa  62  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71144  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1536  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.76 
 
 
210 aa  61.6  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.116113  normal  0.228673 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  26.64 
 
 
212 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9806  chromosome partitioning protein  30.41 
 
 
233 aa  60.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.44 
 
 
217 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.64 
 
 
212 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.44 
 
 
217 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3356  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.85 
 
 
211 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.87 
 
 
212 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.64 
 
 
212 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.07 
 
 
231 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.13 
 
 
232 aa  60.5  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.32 
 
 
212 aa  60.5  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2637  ParA-like protein  29.3 
 
 
203 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.367255  normal  0.182137 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.64 
 
 
212 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.64 
 
 
212 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.57 
 
 
212 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.19 
 
 
224 aa  59.7  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0379  chromosome partitioning ATPase  26.73 
 
 
199 aa  59.7  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.347457  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.64 
 
 
212 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.64 
 
 
212 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.64 
 
 
212 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.06 
 
 
241 aa  59.3  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1305  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.97 
 
 
223 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.153977  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.36 
 
 
212 aa  59.7  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.2 
 
 
232 aa  59.7  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.0000000000116025  unclonable  2.19652e-22 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>