260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3553 on replicon NC_011367
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011367  Gdia_3553  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  439  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5587  hypothetical protein  86.98 
 
 
217 aa  389  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.895248  normal  0.0278536 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  39.64 
 
 
223 aa  134  9e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35 
 
 
216 aa  112  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6419  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.85 
 
 
221 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.997176 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.18 
 
 
232 aa  104  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0681  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.67 
 
 
215 aa  95.9  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3356  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.8 
 
 
211 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.66 
 
 
229 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.23 
 
 
229 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1906  plasmid partitioning-family protein  30.23 
 
 
240 aa  87.8  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.84 
 
 
229 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.39 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.66 
 
 
241 aa  84  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6252  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  32.09 
 
 
223 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0236598  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5120  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.08 
 
 
217 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5598  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000000765743  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0078  hypothetical protein  29.13 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.291271 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.94 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.08 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.85 
 
 
222 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2220  ParA family partition protein  29.13 
 
 
250 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3124  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.36 
 
 
216 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0597611 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4248  chromosome partitioning ATPase  28.44 
 
 
222 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173583  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.7 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.44 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.02 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.858877  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.94 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.699616  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.3 
 
 
214 aa  71.6  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.72 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.44 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6875  ATPases involved in chromosome partitioning-like protein  30.7 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.73 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.25 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5757  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.61 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2166  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  32.5 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.443224  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.77 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.21 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.56 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1510  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.83 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.73 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.86 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.25 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3460  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.47 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.25 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0431  partition protein  35.14 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.95 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5278  stability/partitioning determinant  31.22 
 
 
228 aa  68.2  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.918296  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.25 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  28.37 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.83 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1305  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.83 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.153977  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0077  hypothetical protein  28.29 
 
 
267 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.228977 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.46 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.572043  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.1 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6807  ATPase, ParA type  26.73 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.739325 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2455  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.32 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3304  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.5 
 
 
223 aa  64.7  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.34 
 
 
212 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1451  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.85 
 
 
226 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  30.48 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  30.5 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0098  partition protein  36.3 
 
 
209 aa  63.2  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10243  normal  0.0389744 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3840  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.96 
 
 
226 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2127  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.44 
 
 
238 aa  62.8  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0009  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.64 
 
 
211 aa  62.8  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.363565  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.81 
 
 
212 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.23 
 
 
217 aa  62.4  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  34.92 
 
 
207 aa  62.4  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4611  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.37 
 
 
224 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187425  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  30.77 
 
 
212 aa  62  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2882  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.83 
 
 
226 aa  62  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1482  ParA family protein  28.36 
 
 
221 aa  61.6  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.184868 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1033  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.11 
 
 
276 aa  61.6  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0985734  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03580  partition protein  34.21 
 
 
210 aa  61.6  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.47 
 
 
217 aa  60.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.47 
 
 
212 aa  60.5  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2330  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.21 
 
 
212 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.69 
 
 
251 aa  60.5  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.6 
 
 
212 aa  60.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.47 
 
 
217 aa  60.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.6 
 
 
217 aa  60.1  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.72 
 
 
217 aa  60.1  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.82 
 
 
224 aa  60.1  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40 
 
 
252 aa  59.7  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2325  hypothetical protein  27.45 
 
 
222 aa  59.7  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.338387  normal  0.476496 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.47 
 
 
212 aa  59.7  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4261  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.87 
 
 
193 aa  59.7  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1536  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.03 
 
 
210 aa  59.7  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.116113  normal  0.228673 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2068  putative partition-related protein  36.57 
 
 
210 aa  59.7  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4947  ATPase involved in chromosome partitioning  27.22 
 
 
214 aa  59.3  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.712893  normal 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  24.19 
 
 
222 aa  58.9  0.00000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4271  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.25 
 
 
229 aa  58.9  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.323978  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.6 
 
 
217 aa  58.9  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2816  plasmid partition protein ParA-like  28.42 
 
 
210 aa  58.9  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.284483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>