More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_D2816 on replicon NC_007617
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007617  Nmul_D2816  plasmid partition protein ParA-like  100 
 
 
210 aa  419  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.284483  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0108  hypothetical protein  63.77 
 
 
209 aa  274  6e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.327497  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5462  hypothetical protein  63.11 
 
 
209 aa  246  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4402  hypothetical protein  50.96 
 
 
217 aa  188  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0107502  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_08  DNA-binding protein, putative plasmid partition protein  37.62 
 
 
211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4947  ATPase involved in chromosome partitioning  37.14 
 
 
214 aa  137  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.712893  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.43 
 
 
212 aa  82.4  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.13 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.13 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.69 
 
 
217 aa  78.2  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2330  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.74 
 
 
212 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  29.95 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  34.74 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.08 
 
 
217 aa  77  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.6 
 
 
217 aa  76.6  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.03 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.6 
 
 
217 aa  76.6  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.08 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.05 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.77 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.55 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.08 
 
 
217 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.68 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.02 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  33.68 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.55 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.67 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.06 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.02 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1033  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.5 
 
 
276 aa  72.4  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0985734  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.48 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.81 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6419  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.77 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.997176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.81 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.63 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.11 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.11 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  36.11 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.11 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.11 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.11 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.11 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.11 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  33.16 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.11 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4271  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.95 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.323978  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.5 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4248  chromosome partitioning ATPase  24.88 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173583  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.49 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.71 
 
 
252 aa  67  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.61 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.02 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.49 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6252  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  24.09 
 
 
223 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0236598  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.96 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4285  chromosome partitioning ATPase protein-like  28.87 
 
 
229 aa  65.9  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6875  ATPases involved in chromosome partitioning-like protein  25.45 
 
 
223 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1481  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.41 
 
 
223 aa  64.3  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.111324 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5587  hypothetical protein  28.57 
 
 
217 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.895248  normal  0.0278536 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1536  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.65 
 
 
210 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.116113  normal  0.228673 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.44 
 
 
231 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.58 
 
 
216 aa  63.2  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.08 
 
 
231 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2122  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  34.17 
 
 
199 aa  63.2  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.617804  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.44 
 
 
231 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.44 
 
 
231 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3553  hypothetical protein  29.41 
 
 
217 aa  62.4  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5043  hypothetical protein  28.44 
 
 
229 aa  62  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000269108  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02473  hypothetical protein  30.67 
 
 
222 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1422  ParA family protein  30.14 
 
 
220 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000341933  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2114  ParA family protein  30.14 
 
 
220 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579771  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  25.84 
 
 
228 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1143  ParA family protein  30.14 
 
 
220 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661225  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1503  ParA family protein  30.14 
 
 
220 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000197714  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3289  ParA family protein  30.14 
 
 
220 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000336314  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3176  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  30.14 
 
 
220 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00741579  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2409  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  30.14 
 
 
220 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.08 
 
 
214 aa  60.1  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.14 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.43 
 
 
213 aa  60.5  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1906  plasmid partitioning-family protein  33.16 
 
 
240 aa  60.5  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.87 
 
 
229 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.67 
 
 
220 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.93 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.67 
 
 
220 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.67 
 
 
220 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.08 
 
 
231 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.59 
 
 
210 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.08 
 
 
231 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.57 
 
 
229 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.67 
 
 
220 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.57 
 
 
229 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  30.14 
 
 
220 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  27.88 
 
 
223 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.57 
 
 
215 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.67 
 
 
220 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  26.46 
 
 
222 aa  58.2  0.00000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.19 
 
 
220 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.41 
 
 
209 aa  57.4  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>