More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0681 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0681  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
215 aa  425  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  74.88 
 
 
232 aa  315  3e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.77 
 
 
216 aa  171  6.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  42.79 
 
 
223 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5120  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.52 
 
 
217 aa  159  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.53 
 
 
217 aa  150  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.699616  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3356  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.54 
 
 
211 aa  142  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.28 
 
 
212 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3460  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.03 
 
 
216 aa  135  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.65 
 
 
220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3124  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.44 
 
 
216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0597611 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.31 
 
 
241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1906  plasmid partitioning-family protein  37.69 
 
 
240 aa  126  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5757  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.81 
 
 
215 aa  124  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37 
 
 
219 aa  118  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.858877  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.98 
 
 
215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6419  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.1 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.997176 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2220  ParA family partition protein  38.65 
 
 
250 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.99 
 
 
229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.99 
 
 
229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.99 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1482  ParA family protein  33.99 
 
 
221 aa  108  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.184868 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2455  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.48 
 
 
226 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0077  hypothetical protein  33.82 
 
 
267 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.228977 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6807  ATPase, ParA type  35.21 
 
 
225 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.739325 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2882  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
226 aa  106  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.87 
 
 
234 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0047  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38 
 
 
209 aa  103  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1451  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.92 
 
 
226 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3553  hypothetical protein  34.67 
 
 
217 aa  102  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1510  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.86 
 
 
226 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5587  hypothetical protein  33.82 
 
 
217 aa  102  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.895248  normal  0.0278536 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2166  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  32.83 
 
 
309 aa  102  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.443224  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4611  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.8 
 
 
224 aa  101  9e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187425  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.5 
 
 
209 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.46 
 
 
211 aa  98.6  6e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3840  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.65 
 
 
226 aa  98.6  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.55 
 
 
219 aa  97.8  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.24 
 
 
214 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.17 
 
 
234 aa  94  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.503731  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32 
 
 
222 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.98 
 
 
217 aa  94  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1481  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.67 
 
 
223 aa  92.8  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.111324 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  32.21 
 
 
209 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.89 
 
 
212 aa  90.9  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.05 
 
 
217 aa  90.5  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0078  hypothetical protein  32.2 
 
 
249 aa  89.4  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.291271 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.5 
 
 
224 aa  87.8  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.5 
 
 
207 aa  87.4  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  37.25 
 
 
211 aa  87.8  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  32 
 
 
207 aa  87  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.65 
 
 
214 aa  86.3  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1769  hypothetical protein  31.9 
 
 
222 aa  85.9  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.00507269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  33.49 
 
 
220 aa  85.1  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4482  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.85 
 
 
240 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.41765 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.43 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2637  ParA-like protein  35.03 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.367255  normal  0.182137 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2325  hypothetical protein  31.34 
 
 
222 aa  82  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.338387  normal  0.476496 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.89 
 
 
217 aa  82  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.89 
 
 
217 aa  82  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.11 
 
 
212 aa  82  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2879  hypothetical protein  31.34 
 
 
222 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187633  hitchhiker  0.00000000100318 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.42 
 
 
217 aa  82  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  34.11 
 
 
212 aa  81.3  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.72 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.01 
 
 
217 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1033  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.12 
 
 
276 aa  79.3  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0985734  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.78 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.02 
 
 
217 aa  79  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.5 
 
 
212 aa  78.2  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.17 
 
 
211 aa  76.6  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.51 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.85 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.97 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5279  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.66 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0025  para protein  32.17 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00204905  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.85 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.2 
 
 
216 aa  72.4  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.22 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  32.85 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.79 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.77 
 
 
211 aa  72  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.85 
 
 
212 aa  72  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6541  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.82 
 
 
221 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.975947  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.85 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.85 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.19 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1451  hypothetical protein  29.53 
 
 
224 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00188654  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  32.85 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.85 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4224  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.58 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.323869  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>