231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_A0061 on replicon NC_004349
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004349  SO_A0061  parA protein, putative  100 
 
 		 228 aa  462  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0653211  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4349  ParA protein, putative  95.18 
 
 		 228 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.108838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4687  ParA protein, putative  95.18 
 
 		 228 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2810  ParA protein, putative  58.48 
 
 		 231 aa  243  9.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0568831  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3579  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  44.14 
 
 		 227 aa  187  9e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.299225  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5433  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.66 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0283  putative partition protein ParA  35.62 
 
 		 228 aa  144  8.000000000000001e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0704  chromosome partitioning protein  37.61 
 
 		 224 aa  142  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8771  chromosome partitioning ATPase  37.61 
 
 		 226 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2127  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.49 
 
 		 238 aa  141  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2630  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.59 
 
 		 232 aa  138  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2890  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.14 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2944  ParA chromosome partitioning protein  37.78 
 
 		 238 aa  129  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5170  ParA protein, putative  30.68 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.433255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6491  ParA protein, putative  37.2 
 
 		 219 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4303  chromosome partitioning protein  32.3 
 
 		 252 aa  125  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4551  hypothetical protein  26.75 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6380  hypothetical protein  27.83 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9806  chromosome partitioning protein  27.8 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  28.96 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.91 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.7 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.78 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.09 
 
 		 251 aa  72  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.43 
 
 		 211 aa  71.6  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.29 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.48 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5278  stability/partitioning determinant  26.67 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.918296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.48 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4271  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.12 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.323978  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.72 
 
 		 212 aa  67  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  30.65 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.38 
 
 		 217 aa  62  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  27.18 
 
 		 228 aa  62  0.000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.56 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5279  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.34 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.29 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.64 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.23 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.26 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.64 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.26 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.26 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.26 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.68 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1906  plasmid partitioning-family protein  31.16 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6252  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  24.5 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0236598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4164  hypothetical protein  24.34 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0393565  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5598  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.15 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000000765743  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.09 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  25 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5120  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.93 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.25 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.23 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.21 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.48 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2166  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  28.47 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.443224  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.89 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.572043  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.49 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.7 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.699616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4261  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.04 
 
 		 193 aa  55.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2330  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.03 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  30.77 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  28.03 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.12 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  24.59 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.55 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.84 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.55 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.503731  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.84 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2777  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.11 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.84936 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.84 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.84 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.71 
 
 		 241 aa  53.1  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.84 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.84 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.84 
 
 		 231 aa  52.4  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2882  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.43 
 
 		 226 aa  52  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4248  chromosome partitioning ATPase  24.51 
 
 		 222 aa  52.4  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.41 
 
 		 229 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0431  partition protein  24.44 
 
 		 213 aa  51.6  0.000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.03 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.27 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.27 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6807  ATPase, ParA type  32.65 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.739325 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4285  chromosome partitioning ATPase protein-like  22.44 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1769  hypothetical protein  22.02 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.00507269 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6875  ATPases involved in chromosome partitioning-like protein  23 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.7 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.858877  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.73 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  30.86 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.74 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.27 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.27 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0098  partition protein  29.19 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10243  normal  0.0389744 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.27 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8214  putative crown gall tumor protein VirC1  25.85 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144693  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>