More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6380 on replicon NC_009622
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009622  Smed_6380  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  483  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9806  chromosome partitioning protein  66.96 
 
 		 233 aa  313  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4551  hypothetical protein  62.5 
 
 		 237 aa  286  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4164  hypothetical protein  40.87 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0393565  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4349  ParA protein, putative  30.39 
 
 		 228 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.108838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4687  ParA protein, putative  30.39 
 
 		 228 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2810  ParA protein, putative  33.06 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0568831  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0061  parA protein, putative  27.83 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0653211  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2630  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.45 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2127  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.2 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2890  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.56 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4271  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.58 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.323978  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4303  chromosome partitioning protein  29.35 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.14 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.85 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3579  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  26.96 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.299225  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0283  putative partition protein ParA  29.56 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.6 
 
 		 212 aa  67  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.51 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.63 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.63 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.63 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8214  putative crown gall tumor protein VirC1  33.33 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144693  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  26.15 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.74 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.2 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6491  ParA protein, putative  27.27 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.74 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  31.15 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.67 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.74 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.6 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.61 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0183  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.15 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150447  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1377  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.45 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.51 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.28 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.4 
 
 		 217 aa  62  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  32.74 
 
 		 220 aa  62  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.86 
 
 		 217 aa  62  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  32 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0704  chromosome partitioning protein  27.46 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.86 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.74 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.69 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.86 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.52 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.2 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.2 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.2 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.05 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.2 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  33.06 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.2 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.2 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.2 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  31.2 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.2 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.36 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.59 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2330  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.2 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2944  ParA chromosome partitioning protein  30.39 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  30.2 
 
 		 257 aa  58.5  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.22 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.88 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.97 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  24.12 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.38 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3318  chromosome partitioning ATPase protein-like  28.06 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.04 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.7 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5433  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.35 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.38 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  25.53 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  25.21 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.79 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.21 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.21 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.21 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.21 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.21 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.64 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1906  plasmid partitioning-family protein  26.39 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.47 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.64 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.64 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1143  ParA family protein  25.42 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661225  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3289  ParA family protein  25.42 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000336314  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2409  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  25.42 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2114  ParA family protein  25.42 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579771  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.91 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1503  ParA family protein  25.42 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000197714  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5819  plasmid partitioning ATPase  24.56 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.21 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3176  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  25.42 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00741579  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6226  chromosome partitioning ATPase  25.71 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.307356 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>