278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5278 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5278  stability/partitioning determinant  100 
 
 		 228 aa  465  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.918296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0704  chromosome partitioning protein  31.08 
 
 		 224 aa  92.8  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8771  chromosome partitioning ATPase  30.77 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0283  putative partition protein ParA  35.79 
 
 		 228 aa  85.9  4e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3579  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  29.91 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.299225  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.76 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6491  ParA protein, putative  30.85 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5170  ParA protein, putative  28.23 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.433255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4687  ParA protein, putative  27.78 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4349  ParA protein, putative  27.78 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.108838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2630  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.89 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0061  parA protein, putative  26.67 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0653211  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2810  ParA protein, putative  28.57 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0568831  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2220  ParA family partition protein  31.66 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2890  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.91 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3553  hypothetical protein  31.22 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6252  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  27.95 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0236598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4303  chromosome partitioning protein  27.01 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.85 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  37.23 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5587  hypothetical protein  28.79 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.895248  normal  0.0278536 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2127  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.07 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.8 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.8 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5433  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.26 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.55 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6875  ATPases involved in chromosome partitioning-like protein  29 
 
 		 223 aa  62  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.09 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  34.3 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.3 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.35 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2777  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.06 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.84936 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4164  hypothetical protein  26.01 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0393565  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4482  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.54 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.41765 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2944  ParA chromosome partitioning protein  26.75 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.15 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1536  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.56 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.116113  normal  0.228673 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.8 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4271  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.01 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.323978  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.95 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2166  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  33.58 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.443224  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6807  ATPase, ParA type  33.59 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.739325 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1377  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.37 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4947  ATPase involved in chromosome partitioning  28.04 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.712893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.89 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0411  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.89 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.5 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.89 
 
 		 220 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.89 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3356  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.73 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  32.79 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.43 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.858877  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0077  hypothetical protein  32.03 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.228977 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0821  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.34 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.051634 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1345  hypothetical protein  29.57 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.17 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.45 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.17 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.29 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.59 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5598  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.07 
 
 		 192 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000000765743  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2197  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.56 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.139506 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.29 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.52 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3136  putative partition-related protein  36.04 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0178894  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8214  putative crown gall tumor protein VirC1  28.27 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144693  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.86 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0681  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.88 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3315  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.8 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.89 
 
 		 229 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.71 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2068  putative partition-related protein  31.78 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.52 
 
 		 229 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.77 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0226442  normal  0.408806 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  30.15 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2655  putative partition-related protein  29.86 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.634269 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3840  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.45 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1239  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.88 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.41 
 
 		 220 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.41 
 
 		 220 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4248  chromosome partitioning ATPase  27.81 
 
 		 222 aa  53.1  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35 
 
 		 217 aa  52.8  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.15 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.37 
 
 		 231 aa  52  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.48 
 
 		 214 aa  52  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 212 aa  52  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.37 
 
 		 231 aa  51.6  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.37 
 
 		 231 aa  51.6  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.37 
 
 		 231 aa  51.6  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.37 
 
 		 231 aa  51.6  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.37 
 
 		 231 aa  51.6  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.11 
 
 		 212 aa  51.6  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>