More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0411 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0411  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
194 aa  385  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0860  ParA family chromosome partitioning ATPase  60.62 
 
 
219 aa  224  6e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4554  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.35 
 
 
196 aa  150  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4881  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.31 
 
 
212 aa  145  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270203  hitchhiker  0.000435633 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3446  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.89 
 
 
195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2658  hypothetical protein  38.89 
 
 
195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0821  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.27 
 
 
196 aa  124  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.051634 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1536  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.53 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.116113  normal  0.228673 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.47 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1305  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.47 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.153977  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3315  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.47 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3304  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.53 
 
 
223 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1410  hypothetical protein  29.06 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.499292  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01091  hypothetical protein  29.06 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.535106  normal  0.920257 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.79 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0098  partition protein  36.8 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10243  normal  0.0389744 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06541  chromosome partitioning ATPase protein  29.61 
 
 
223 aa  65.5  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.849142  normal  0.485277 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  22.97 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4776  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.05 
 
 
209 aa  62.8  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.74468  normal 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  28.38 
 
 
228 aa  62.4  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00611  chromosome partitioning ATPase protein  28.71 
 
 
223 aa  62.4  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1875  ParA-like protein  35.77 
 
 
212 aa  61.6  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1550  putative partition-related protein  35.77 
 
 
212 aa  61.6  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131235 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0052  hypothetical protein  28.22 
 
 
221 aa  61.6  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 
212 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.9 
 
 
209 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6252  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  29.09 
 
 
223 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0236598  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  38.17 
 
 
207 aa  60.1  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 
220 aa  59.7  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2866  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.4 
 
 
206 aa  59.3  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1675  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.61 
 
 
205 aa  59.7  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00581  chromosome partitioning ATPase protein  28.22 
 
 
223 aa  59.7  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.214222  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.4 
 
 
206 aa  59.3  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110983  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.1 
 
 
212 aa  58.9  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.9 
 
 
234 aa  58.9  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.503731  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.1 
 
 
212 aa  58.9  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  30.85 
 
 
212 aa  58.5  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00591  chromosome partitioning ATPase protein  27.72 
 
 
223 aa  58.2  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0391  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 
264 aa  57.8  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000118454  unclonable  0.000000000458103 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.36 
 
 
215 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0226442  normal  0.408806 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5278  stability/partitioning determinant  30 
 
 
228 aa  57.4  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.918296  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.1 
 
 
212 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0129  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.86 
 
 
217 aa  56.6  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0805  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.62 
 
 
206 aa  56.6  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.50757e-20  unclonable  0.0000000618537 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1153  putative partition-related protein  35 
 
 
206 aa  56.6  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.15 
 
 
217 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.6 
 
 
219 aa  56.6  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.62 
 
 
212 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.74 
 
 
212 aa  56.6  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.62 
 
 
212 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2449  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.83 
 
 
219 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0538918  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5775  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.83 
 
 
222 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.76 
 
 
224 aa  55.8  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.83 
 
 
219 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2491  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.83 
 
 
219 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.926396  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1008  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.67 
 
 
212 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2444  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.83 
 
 
219 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.39 
 
 
212 aa  55.8  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1377  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.81 
 
 
211 aa  55.8  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.8 
 
 
207 aa  55.8  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.61 
 
 
217 aa  55.8  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.14 
 
 
212 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.19 
 
 
212 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.14 
 
 
212 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3490  ParA family ATPase  35.83 
 
 
212 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  34.78 
 
 
201 aa  54.7  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.58 
 
 
212 aa  54.7  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1360  ParA family protein, putative  27.94 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0573305  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2359  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.71 
 
 
219 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723291  normal  0.455428 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.14 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03580  partition protein  32 
 
 
210 aa  53.9  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.14 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3460  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.06 
 
 
216 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.1 
 
 
212 aa  53.9  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.74 
 
 
212 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0779  chromosome partitioning ATPase  24.88 
 
 
231 aa  53.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.352348  normal  0.0863707 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0850  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.71 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.668174  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6491  ParA protein, putative  28.42 
 
 
219 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.64 
 
 
217 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.14 
 
 
212 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.61 
 
 
212 aa  53.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6875  ATPases involved in chromosome partitioning-like protein  28.18 
 
 
223 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2973  ParA family protein  32.5 
 
 
207 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510642  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0699  ParA family protein  32.5 
 
 
207 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2314  ParA family protein  32.5 
 
 
207 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0184356  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0550  putative partition-related protein  29.65 
 
 
208 aa  52.8  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.840811 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1041  ParA family protein  32.5 
 
 
207 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1626  ParA family protein  32.5 
 
 
207 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00224937  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1202  ParA family protein  32.23 
 
 
331 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0846  ParA family protein  32.23 
 
 
207 aa  52.8  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.89485  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.12 
 
 
212 aa  52.8  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1047  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  32.5 
 
 
207 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.4276  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.28 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.69 
 
 
231 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0183  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.62 
 
 
221 aa  52.4  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150447  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.69 
 
 
217 aa  52.4  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.69 
 
 
231 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.58 
 
 
213 aa  52.4  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.69 
 
 
231 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.69 
 
 
231 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220398 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>