More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1153 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1153  putative partition-related protein  100 
 
 		 206 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1675  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.76 
 
 		 205 aa  270  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4398  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.17 
 
 		 206 aa  267  8e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1239  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.27 
 
 		 205 aa  264  5.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2777  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.06 
 
 		 220 aa  262  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.84936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.56 
 
 		 206 aa  252  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2866  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.56 
 
 		 206 aa  252  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5775  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.13 
 
 		 222 aa  249  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1298  putative partition-related protein  58.3 
 
 		 224 aa  249  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150444 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2491  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.13 
 
 		 219 aa  248  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.926396  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2449  cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.65 
 
 		 219 aa  247  9e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0538918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.65 
 
 		 219 aa  247  9e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2444  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.65 
 
 		 219 aa  247  9e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2199  cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.33 
 
 		 234 aa  246  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.685518 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2359  cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.65 
 
 		 219 aa  245  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723291  normal  0.455428 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0850  cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.74 
 
 		 219 aa  245  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.668174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.59 
 
 		 206 aa  244  6.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0550  putative partition-related protein  54.59 
 
 		 208 aa  241  3.9999999999999997e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.840811 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2655  putative partition-related protein  58.82 
 
 		 221 aa  241  5e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.634269 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2197  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.82 
 
 		 221 aa  241  5e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.139506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3490  ParA family ATPase  59.13 
 
 		 212 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2314  ParA family protein  57.77 
 
 		 207 aa  240  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0184356  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0699  ParA family protein  57.77 
 
 		 207 aa  240  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1202  ParA family protein  57.77 
 
 		 331 aa  240  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2973  ParA family protein  57.77 
 
 		 207 aa  240  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510642  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1626  ParA family protein  57.77 
 
 		 207 aa  240  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00224937  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1008  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.65 
 
 		 212 aa  240  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1041  ParA family protein  57.77 
 
 		 207 aa  240  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1047  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  57.77 
 
 		 207 aa  240  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.4276  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2389  putative partition-related protein  58.33 
 
 		 217 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467103 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0846  ParA family protein  58.54 
 
 		 207 aa  238  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.89485  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0805  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.2 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.50757e-20  unclonable  0.0000000618537 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  46.34 
 
 		 201 aa  169  4e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2068  putative partition-related protein  44.88 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0009  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.79 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.363565  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0189  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40 
 
 		 235 aa  141  7e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1550  putative partition-related protein  38.1 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131235 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1875  ParA-like protein  38.1 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3136  putative partition-related protein  39.42 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0178894  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3113  hypothetical protein  35.82 
 
 		 208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0098  partition protein  35.1 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10243  normal  0.0389744 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0391  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.06 
 
 		 264 aa  108  5e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000118454  unclonable  0.000000000458103 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03580  partition protein  32.55 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.1 
 
 		 213 aa  101  8e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.572043  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0431  partition protein  30.62 
 
 		 213 aa  101  8e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02473  hypothetical protein  33.55 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0205  putative partitioning protein ParA  25.12 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.05 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  31.58 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1451  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.88 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.41 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2882  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.42 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.26 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.29 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.68 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.6 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2455  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.44 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1536  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.39 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.116113  normal  0.228673 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1510  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.11 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3840  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.88 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.71 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.29 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  31.44 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.29 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.79 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.59 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.29 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.91 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.72 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.72 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.72 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.91 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.29 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4611  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.88 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187425  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.29 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.29 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.88 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.88 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.13 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.59 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.1 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.59 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.3 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  36.67 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.09 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1953  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.35 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.2 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.48 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.1 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.77 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  35.77 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  34.96 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5343  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.5 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.96 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.44 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000187977 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.96 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>