More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3914 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
206 aa  413  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  75.12 
 
 
206 aa  313  8e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110983  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2866  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  75.12 
 
 
206 aa  313  8e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1239  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  72.91 
 
 
205 aa  311  5.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4398  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  71.36 
 
 
206 aa  304  6e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1675  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  70.1 
 
 
205 aa  296  1e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2777  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.29 
 
 
220 aa  267  8.999999999999999e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.84936 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2389  putative partition-related protein  60.19 
 
 
217 aa  256  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467103 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2655  putative partition-related protein  60 
 
 
221 aa  254  5e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.634269 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2197  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  60 
 
 
221 aa  254  5e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.139506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3490  ParA family ATPase  60.87 
 
 
212 aa  250  8.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1008  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.39 
 
 
212 aa  249  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2449  cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.78 
 
 
219 aa  248  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0538918  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.78 
 
 
219 aa  248  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2444  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.78 
 
 
219 aa  248  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2491  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.78 
 
 
219 aa  248  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.926396  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0850  cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.78 
 
 
219 aa  246  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.668174  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5775  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.29 
 
 
222 aa  247  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2359  cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.29 
 
 
219 aa  245  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723291  normal  0.455428 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2199  cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.94 
 
 
234 aa  245  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.685518 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1153  putative partition-related protein  56.59 
 
 
206 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2314  ParA family protein  58.82 
 
 
207 aa  240  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0184356  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0699  ParA family protein  58.82 
 
 
207 aa  240  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1626  ParA family protein  58.82 
 
 
207 aa  240  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00224937  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2973  ParA family protein  58.82 
 
 
207 aa  240  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510642  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1047  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  58.82 
 
 
207 aa  240  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.4276  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1041  ParA family protein  58.82 
 
 
207 aa  240  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1202  ParA family protein  58.82 
 
 
331 aa  238  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0846  ParA family protein  57.84 
 
 
207 aa  237  8e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.89485  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0550  putative partition-related protein  52.4 
 
 
208 aa  226  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.840811 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1298  putative partition-related protein  50.68 
 
 
224 aa  213  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150444 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0805  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.12 
 
 
206 aa  180  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.50757e-20  unclonable  0.0000000618537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2068  putative partition-related protein  45.85 
 
 
210 aa  170  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  47.83 
 
 
201 aa  168  5e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0009  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.83 
 
 
211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.363565  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0189  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.62 
 
 
235 aa  128  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3136  putative partition-related protein  39.32 
 
 
209 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0178894  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3113  hypothetical protein  37.2 
 
 
208 aa  119  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1550  putative partition-related protein  37.02 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131235 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1875  ParA-like protein  37.02 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0391  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.18 
 
 
264 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000118454  unclonable  0.000000000458103 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0098  partition protein  36.36 
 
 
209 aa  108  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10243  normal  0.0389744 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.88 
 
 
213 aa  99.4  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.572043  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0431  partition protein  29.95 
 
 
213 aa  97.8  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03580  partition protein  34.11 
 
 
210 aa  97.1  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0205  putative partitioning protein ParA  25.84 
 
 
246 aa  86.3  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.61 
 
 
217 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.1 
 
 
232 aa  74.7  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.1 
 
 
232 aa  74.7  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.65 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5598  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.9 
 
 
192 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000000765743  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02473  hypothetical protein  25.84 
 
 
222 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.74 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.18 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.5 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.21 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.69 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.5 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.73 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.5 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.46 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  34.13 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.58 
 
 
231 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.58 
 
 
231 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.58 
 
 
231 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.58 
 
 
231 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.58 
 
 
231 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.58 
 
 
231 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.06 
 
 
217 aa  68.2  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.08 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0183  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.83 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150447  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.24 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.31 
 
 
212 aa  67.8  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.71 
 
 
217 aa  67.8  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.26 
 
 
217 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.41 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.97 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  31.12 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.26 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.77 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.33 
 
 
232 aa  65.5  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.84 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1953  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.8 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4271  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.36 
 
 
229 aa  65.1  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.323978  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.15 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.71 
 
 
214 aa  64.7  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4611  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.68 
 
 
224 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187425  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.66 
 
 
212 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.74 
 
 
210 aa  63.9  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.85 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  29.85 
 
 
212 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2330  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.5 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  33.55 
 
 
220 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.62 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.19 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.77 
 
 
251 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.68 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.81 
 
 
234 aa  63.2  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.503731  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.19 
 
 
212 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>