More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2866 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2866  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 		 206 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 		 206 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1239  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  72.55 
 
 		 205 aa  314  7e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  75.12 
 
 		 206 aa  313  8e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1675  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  74.51 
 
 		 205 aa  309  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4398  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  69.42 
 
 		 206 aa  295  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2777  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  65.22 
 
 		 220 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.84936 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2389  putative partition-related protein  63.9 
 
 		 217 aa  272  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467103 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2197  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.93 
 
 		 221 aa  272  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.139506 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2655  putative partition-related protein  62.93 
 
 		 221 aa  271  6e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.634269 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2199  cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.32 
 
 		 234 aa  267  8e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.685518 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0850  cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.65 
 
 		 219 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.668174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5775  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.17 
 
 		 222 aa  260  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2491  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.17 
 
 		 219 aa  259  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.926396  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.68 
 
 		 219 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2444  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.68 
 
 		 219 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2449  cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.68 
 
 		 219 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0538918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2359  cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.17 
 
 		 219 aa  258  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723291  normal  0.455428 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1008  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.58 
 
 		 212 aa  257  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3490  ParA family ATPase  60.58 
 
 		 212 aa  255  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1626  ParA family protein  59.8 
 
 		 207 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00224937  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0699  ParA family protein  59.8 
 
 		 207 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2314  ParA family protein  59.8 
 
 		 207 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0184356  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1047  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  59.8 
 
 		 207 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.4276  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1041  ParA family protein  59.8 
 
 		 207 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2973  ParA family protein  59.8 
 
 		 207 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510642  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1153  putative partition-related protein  57.56 
 
 		 206 aa  252  3e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1202  ParA family protein  59.8 
 
 		 331 aa  252  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0846  ParA family protein  59.31 
 
 		 207 aa  250  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.89485  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0550  putative partition-related protein  54.59 
 
 		 208 aa  237  8e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.840811 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1298  putative partition-related protein  54.46 
 
 		 224 aa  231  7.000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150444 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0805  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.14 
 
 		 206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.50757e-20  unclonable  0.0000000618537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2068  putative partition-related protein  47.12 
 
 		 210 aa  175  5e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  46.34 
 
 		 201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0009  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.38 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.363565  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3136  putative partition-related protein  40.29 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0178894  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1550  putative partition-related protein  38.35 
 
 		 212 aa  125  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131235 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0189  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.82 
 
 		 235 aa  125  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1875  ParA-like protein  38.35 
 
 		 212 aa  125  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0391  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.76 
 
 		 264 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000118454  unclonable  0.000000000458103 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3113  hypothetical protein  36.71 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0098  partition protein  33.82 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10243  normal  0.0389744 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03580  partition protein  33.97 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0431  partition protein  32.39 
 
 		 213 aa  99  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.13 
 
 		 213 aa  98.6  6e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.572043  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0205  putative partitioning protein ParA  24.88 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.16 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.96 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.84 
 
 		 212 aa  72  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.21 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.96 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.92 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.69 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.23 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.12 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.3 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  37.69 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.4 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.4 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.12 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.4 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.4 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.1 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.82 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02473  hypothetical protein  26.85 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.92 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.82 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0183  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.73 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150447  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.15 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.1 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1536  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.06 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.116113  normal  0.228673 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.15 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.05 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.52 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.15 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.4 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  37.4 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.77 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.93 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.29 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.69 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.59 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  36.59 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.5 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  31.52 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.77 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.77 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2330  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.77 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.85 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  32.31 
 
 		 209 aa  62  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.46 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3315  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.98 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.46 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.46 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.46 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.46 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.46 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  34.96 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>