More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1451 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1451  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 		 226 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1510  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  96.46 
 
 		 226 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4611  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  92.48 
 
 		 224 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187425  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3840  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  81.86 
 
 		 226 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2455  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  82.3 
 
 		 226 aa  389  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2882  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  82.3 
 
 		 226 aa  388  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6807  ATPase, ParA type  83.19 
 
 		 225 aa  384  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.739325 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5757  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.9 
 
 		 215 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3460  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.97 
 
 		 216 aa  165  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3124  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.23 
 
 		 216 aa  162  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0597611 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3356  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.41 
 
 		 211 aa  138  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.47 
 
 		 220 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.08 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1906  plasmid partitioning-family protein  34.63 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2166  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  31.96 
 
 		 309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.443224  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0077  hypothetical protein  35.58 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.228977 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2220  ParA family partition protein  34.3 
 
 		 250 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.56 
 
 		 241 aa  108  8.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0078  hypothetical protein  34.12 
 
 		 249 aa  108  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.291271 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  32.52 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.17 
 
 		 232 aa  105  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.27 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.04 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0681  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.92 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.65 
 
 		 229 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.65 
 
 		 229 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.96 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6419  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.01 
 
 		 221 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.997176 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.71 
 
 		 212 aa  92  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.77 
 
 		 219 aa  89.4  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.858877  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5120  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.4 
 
 		 217 aa  85.9  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0047  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.8 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1481  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.29 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.111324 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1482  ParA family protein  29.76 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.184868 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  29.9 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.699616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.05 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.05 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1675  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.88 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4482  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.56 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.41765 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.14 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.96 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.5 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.78 
 
 		 212 aa  72  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  30 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.64 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  30.66 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.78 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.14 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1153  putative partition-related protein  34.88 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  32.81 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.05 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  26.54 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5587  hypothetical protein  27.6 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.895248  normal  0.0278536 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.27 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2777  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.43 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.84936 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.27 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.05 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5598  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.22 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000000765743  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.04 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.76 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.76 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0129  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.19 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.76 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0098  partition protein  27.84 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10243  normal  0.0389744 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.27 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2068  putative partition-related protein  29.1 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.27 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.76 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.27 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.56 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.56 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.52 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  29.7 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.44 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  29.27 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0805  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.88 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.50757e-20  unclonable  0.0000000618537 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.27 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.78 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3553  hypothetical protein  25.85 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2197  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.76 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.139506 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2389  putative partition-related protein  30.88 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467103 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.27 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1008  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.95 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.29 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3490  ParA family ATPase  31.95 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2655  putative partition-related protein  29.76 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.634269 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.75 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.27 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.78 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.27 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.46 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1769  hypothetical protein  27.4 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.00507269 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.45 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2637  ParA-like protein  29.47 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.367255  normal  0.182137 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.27 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3304  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.6 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.17 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.27 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>