More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1482 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1482  ParA family protein  100 
 
 
221 aa  440  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.184868 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1481  cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.38 
 
 
223 aa  276  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.111324 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.67 
 
 
215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.19 
 
 
229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.19 
 
 
229 aa  108  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.96 
 
 
220 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.2 
 
 
229 aa  106  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.26 
 
 
241 aa  105  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0681  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.99 
 
 
215 aa  105  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  33.78 
 
 
223 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1906  plasmid partitioning-family protein  33.8 
 
 
240 aa  103  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.18 
 
 
232 aa  102  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3356  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.06 
 
 
211 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.4 
 
 
216 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0077  hypothetical protein  32.56 
 
 
267 aa  90.9  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.228977 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2882  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.18 
 
 
226 aa  90.5  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.02 
 
 
217 aa  89.4  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.699616  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2455  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.67 
 
 
226 aa  87.8  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.07 
 
 
212 aa  88.2  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5120  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.85 
 
 
217 aa  87.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3460  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.58 
 
 
216 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2166  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  32.84 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.443224  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.58 
 
 
219 aa  83.2  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.858877  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4611  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.19 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187425  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6807  ATPase, ParA type  31.07 
 
 
225 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.739325 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.17 
 
 
234 aa  80.9  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5757  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.77 
 
 
215 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3840  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.04 
 
 
226 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1451  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.76 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2220  ParA family partition protein  30.77 
 
 
250 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3124  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.1 
 
 
216 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0597611 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1510  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.43 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  29.11 
 
 
207 aa  76.3  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.47 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6419  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.85 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.997176 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.29 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0078  hypothetical protein  29.47 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.291271 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2879  hypothetical protein  30.62 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187633  hitchhiker  0.00000000100318 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3304  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.91 
 
 
223 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.41 
 
 
217 aa  67.4  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.83 
 
 
214 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0047  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.72 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  34.87 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3315  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.05 
 
 
223 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  28.57 
 
 
209 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4482  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.91 
 
 
240 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.41765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.23 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0226442  normal  0.408806 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1305  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.28 
 
 
223 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.153977  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5789  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.82 
 
 
278 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.28 
 
 
223 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.2 
 
 
232 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.0000000000116025  unclonable  2.19652e-22 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03280  parA family protein  28.5 
 
 
231 aa  62.4  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3553  hypothetical protein  28.36 
 
 
217 aa  61.6  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.14 
 
 
209 aa  62  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  28.5 
 
 
213 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.51 
 
 
209 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.47 
 
 
211 aa  61.2  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.47 
 
 
211 aa  61.2  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.57 
 
 
216 aa  60.5  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0467  cell division ATPase MinD  24.89 
 
 
262 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.543355  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0009  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.86 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.363565  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2325  hypothetical protein  28.23 
 
 
222 aa  60.1  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.338387  normal  0.476496 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  30.5 
 
 
201 aa  60.1  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1536  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.7 
 
 
210 aa  59.7  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.116113  normal  0.228673 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25090  chromosome partitioning ATPase  26.81 
 
 
305 aa  60.1  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.419611  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.33 
 
 
212 aa  59.7  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 
211 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0183  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.52 
 
 
221 aa  58.9  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150447  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1769  hypothetical protein  27.18 
 
 
222 aa  58.9  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.00507269 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.25 
 
 
212 aa  58.9  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1745  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.39 
 
 
213 aa  58.5  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.543877  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.5 
 
 
213 aa  57.4  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.572043  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5279  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.56 
 
 
213 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5587  hypothetical protein  26.37 
 
 
217 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.895248  normal  0.0278536 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.38 
 
 
211 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.5 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  20.28 
 
 
222 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.48 
 
 
217 aa  56.6  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0440  septum site-determining protein MinD  24.05 
 
 
262 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0129  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.68 
 
 
217 aa  57  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.47 
 
 
212 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.96 
 
 
234 aa  56.2  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.503731  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.92 
 
 
219 aa  56.2  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1378  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.02 
 
 
211 aa  56.2  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.626674  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0431  partition protein  29.15 
 
 
213 aa  56.2  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7009  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.49 
 
 
223 aa  55.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.295052  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0207  parA family protein  27.69 
 
 
222 aa  55.8  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03580  partition protein  35.83 
 
 
210 aa  55.8  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0395  cell division ATPase MinD  23.63 
 
 
262 aa  55.5  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.83 
 
 
249 aa  55.5  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.54 
 
 
212 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0098  partition protein  28.06 
 
 
209 aa  55.5  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10243  normal  0.0389744 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1524  cell division ATPase MinD  23.63 
 
 
262 aa  55.5  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.016628  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.5 
 
 
212 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.43 
 
 
210 aa  55.5  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0350  cell division ATPase MinD  22.5 
 
 
261 aa  55.5  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0402773  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1285  hypothetical protein  25.89 
 
 
222 aa  55.1  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.016663 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.56 
 
 
217 aa  55.1  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1680  hypothetical protein  37.5 
 
 
211 aa  55.1  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.679008  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  24.4 
 
 
206 aa  55.1  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>