More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1481 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1481  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
223 aa  451  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.111324 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1482  ParA family protein  62.38 
 
 
221 aa  276  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.184868 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.98 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.98 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.95 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3356  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.65 
 
 
211 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.01 
 
 
229 aa  106  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.5 
 
 
220 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  32.2 
 
 
223 aa  98.2  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.92 
 
 
219 aa  96.3  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.858877  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.95 
 
 
241 aa  95.5  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.63 
 
 
217 aa  93.2  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.699616  normal 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.62 
 
 
216 aa  92.8  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1906  plasmid partitioning-family protein  33.33 
 
 
240 aa  92.4  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5120  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.41 
 
 
217 aa  92  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.71 
 
 
232 aa  89.4  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0681  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.67 
 
 
215 aa  89  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3840  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.21 
 
 
226 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.1 
 
 
212 aa  87.4  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2220  ParA family partition protein  31.75 
 
 
250 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4611  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.77 
 
 
224 aa  85.5  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187425  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2455  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.77 
 
 
226 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2882  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.29 
 
 
226 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0077  hypothetical protein  30.7 
 
 
267 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.228977 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1451  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.29 
 
 
226 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2166  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  31.43 
 
 
309 aa  83.2  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.443224  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1510  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.81 
 
 
226 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6807  ATPase, ParA type  29.81 
 
 
225 aa  78.2  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.739325 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.41 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6419  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.78 
 
 
221 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.997176 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3460  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.5 
 
 
216 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0078  hypothetical protein  31.39 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.291271 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.16 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  31.43 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.56 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2637  ParA-like protein  32.39 
 
 
203 aa  73.9  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.367255  normal  0.182137 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.43 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.07 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  37.14 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.28 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.22 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2068  putative partition-related protein  32.29 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.72 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.72 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2401  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.96 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266448  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3124  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.5 
 
 
216 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0597611 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5757  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.34 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03280  parA family protein  28.8 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7009  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.7 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.295052  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.61 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.95 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.95 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.95 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.81 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.1 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.95 
 
 
213 aa  65.1  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000187977 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  40.17 
 
 
201 aa  65.1  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.37 
 
 
209 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.59 
 
 
231 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.1 
 
 
231 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.6 
 
 
217 aa  64.7  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.1 
 
 
231 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3600  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  31.84 
 
 
219 aa  64.3  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.43 
 
 
212 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.88 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.5 
 
 
215 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0226442  normal  0.408806 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.73 
 
 
217 aa  63.2  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.92 
 
 
212 aa  62.8  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.44 
 
 
232 aa  62.8  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.0000000000116025  unclonable  2.19652e-22 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  30.67 
 
 
222 aa  62.4  0.000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.95 
 
 
212 aa  61.6  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.95 
 
 
212 aa  62  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  25.11 
 
 
228 aa  61.6  0.000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1536  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.05 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.116113  normal  0.228673 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2816  plasmid partition protein ParA-like  31.41 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.284483  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2879  hypothetical protein  26.11 
 
 
222 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187633  hitchhiker  0.00000000100318 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.95 
 
 
212 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1953  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 
187 aa  60.5  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0047  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.46 
 
 
209 aa  60.1  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0467  cell division ATPase MinD  25.83 
 
 
262 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.543355  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.39 
 
 
212 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0550  putative partition-related protein  30.92 
 
 
208 aa  59.7  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.840811 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  31.32 
 
 
212 aa  59.7  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1745  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 
213 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.543877  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  25.37 
 
 
206 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.95 
 
 
212 aa  59.7  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.9 
 
 
212 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.39 
 
 
212 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.95 
 
 
207 aa  59.3  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.43 
 
 
212 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03580  partition protein  36.97 
 
 
210 aa  59.3  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.46 
 
 
213 aa  59.7  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.35 
 
 
212 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_002978  WD1217  ParA family protein  28.18 
 
 
280 aa  58.9  0.00000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.41 
 
 
212 aa  59.3  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.9 
 
 
212 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.9 
 
 
212 aa  58.9  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.48 
 
 
217 aa  58.9  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0025  para protein  26.97 
 
 
222 aa  58.9  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00204905  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.92 
 
 
212 aa  58.9  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>