More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4472 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008758  Pnap_4472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
232 aa  480  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.0000000000116025  unclonable  2.19652e-22 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.19 
 
 
242 aa  267  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.37688  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5343  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.61 
 
 
219 aa  152  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5819  plasmid partitioning ATPase  37.61 
 
 
218 aa  152  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3783  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.78 
 
 
222 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0208258  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3896  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.78 
 
 
222 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0003  partition protein  33.94 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000179256  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0183  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.68 
 
 
221 aa  114  8.999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150447  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.36 
 
 
220 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.36 
 
 
220 aa  99.8  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.36 
 
 
220 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.36 
 
 
220 aa  99.8  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.36 
 
 
220 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.36 
 
 
220 aa  99.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.36 
 
 
220 aa  98.6  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  30.36 
 
 
220 aa  98.6  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1422  ParA family protein  30.36 
 
 
220 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000341933  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1143  ParA family protein  30.36 
 
 
220 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661225  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2114  ParA family protein  30.36 
 
 
220 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579771  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3176  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  30.36 
 
 
220 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00741579  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1503  ParA family protein  30.36 
 
 
220 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000197714  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3289  ParA family protein  30.36 
 
 
220 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000336314  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2409  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  30.36 
 
 
220 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.9 
 
 
232 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.46 
 
 
220 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.9 
 
 
232 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  29.46 
 
 
220 aa  95.5  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4151  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.36 
 
 
220 aa  95.1  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.6 
 
 
212 aa  88.2  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.33 
 
 
222 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.53 
 
 
210 aa  87.4  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.77 
 
 
212 aa  85.9  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1978  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.18 
 
 
211 aa  84  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.46 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.41 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.41 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.98 
 
 
211 aa  82  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.24 
 
 
231 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.24 
 
 
231 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.24 
 
 
231 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.17 
 
 
207 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.24 
 
 
231 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.91 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  30.05 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.5 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.79 
 
 
231 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.79 
 
 
231 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.79 
 
 
231 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5082  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.68 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.161986 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4960  hypothetical protein  28.31 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.9 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5389  hypothetical protein  28.31 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.04 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.96 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.96 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.1 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.17 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.64 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.64 
 
 
216 aa  75.1  0.0000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1680  hypothetical protein  28.07 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.679008  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  29.78 
 
 
206 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  28.76 
 
 
228 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.91 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.64 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1378  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.63 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.626674  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.1 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.64 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.64 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.05 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.56 
 
 
219 aa  72.4  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.1 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  26.64 
 
 
212 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  26.64 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.64 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.64 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.64 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.17 
 
 
212 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.64 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.64 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3304  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.25 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1360  ParA family protein, putative  27.52 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0573305  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  26.17 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.52 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.01 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.09 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  28.38 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.15 
 
 
217 aa  68.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.32 
 
 
217 aa  68.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.95 
 
 
211 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.7 
 
 
212 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.19 
 
 
217 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.42 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.98 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.59 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.05 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.69 
 
 
410 aa  66.2  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2477  conjugal plasmid transfer ATPase  23.89 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.826967  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4704  hypothetical protein  23.45 
 
 
460 aa  65.5  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.155939  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2330  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.2 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.98 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>