More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0032 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
234 aa  466  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.73 
 
 
241 aa  274  8e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1906  plasmid partitioning-family protein  61.27 
 
 
240 aa  268  4e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2166  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  61.58 
 
 
309 aa  262  3e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.443224  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.16 
 
 
214 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3460  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40 
 
 
216 aa  139  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3124  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.28 
 
 
216 aa  132  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0597611 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3356  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.32 
 
 
211 aa  129  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5757  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.54 
 
 
215 aa  129  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2455  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2882  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.44 
 
 
226 aa  118  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6807  ATPase, ParA type  35.41 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.739325 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4611  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
224 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187425  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1451  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.08 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1510  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.78 
 
 
226 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3840  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.18 
 
 
226 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.02 
 
 
215 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0078  hypothetical protein  36.28 
 
 
249 aa  105  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.291271 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0681  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.87 
 
 
215 aa  105  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2220  ParA family partition protein  35.68 
 
 
250 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.87 
 
 
232 aa  103  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0077  hypothetical protein  34.88 
 
 
267 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.228977 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.33 
 
 
229 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.33 
 
 
229 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.39 
 
 
229 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  32.54 
 
 
223 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5120  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.62 
 
 
217 aa  96.3  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.5 
 
 
212 aa  94  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.66 
 
 
222 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.71 
 
 
216 aa  92.4  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.86 
 
 
217 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
209 aa  92  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.29 
 
 
212 aa  91.7  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  36.14 
 
 
211 aa  91.7  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.45 
 
 
217 aa  90.5  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.45 
 
 
217 aa  90.5  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.76 
 
 
212 aa  89.7  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.75 
 
 
217 aa  89  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6419  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.38 
 
 
221 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.997176 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.23 
 
 
212 aa  88.6  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.75 
 
 
212 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.83 
 
 
217 aa  88.2  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.699616  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  33.82 
 
 
207 aa  87  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0047  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.57 
 
 
209 aa  87  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.75 
 
 
212 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.73 
 
 
217 aa  86.3  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.41 
 
 
214 aa  86.3  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.75 
 
 
212 aa  86.3  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.78 
 
 
219 aa  86.3  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.858877  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.12 
 
 
217 aa  86.3  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.23 
 
 
212 aa  85.9  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.47 
 
 
212 aa  85.9  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.27 
 
 
212 aa  85.5  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.75 
 
 
212 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  36.23 
 
 
212 aa  85.1  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.27 
 
 
212 aa  85.1  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.27 
 
 
212 aa  85.1  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.35 
 
 
212 aa  85.1  9e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.27 
 
 
212 aa  84.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.47 
 
 
212 aa  84.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.75 
 
 
212 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.27 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  35.27 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.71 
 
 
220 aa  83.6  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  32.85 
 
 
220 aa  84  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  35.27 
 
 
212 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.61 
 
 
217 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  39.68 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.27 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.3 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.18 
 
 
212 aa  82.4  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1033  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.29 
 
 
276 aa  82  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0985734  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.94 
 
 
207 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2637  ParA-like protein  32.2 
 
 
203 aa  81.3  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.367255  normal  0.182137 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.1 
 
 
217 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.68 
 
 
211 aa  81.3  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.78 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  28.91 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.08 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1482  ParA family protein  33.17 
 
 
221 aa  80.9  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.184868 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.29 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.42 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.5 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3553  hypothetical protein  31.25 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2330  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.73 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5587  hypothetical protein  31.16 
 
 
217 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.895248  normal  0.0278536 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.56 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.67 
 
 
211 aa  79  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.67 
 
 
211 aa  79  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2122  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  40.5 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.617804  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.11 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0129  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.71 
 
 
217 aa  75.1  0.0000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3754  hypothetical protein  28.17 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.6 
 
 
211 aa  75.1  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4261  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.81 
 
 
193 aa  74.7  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.743833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>