More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2723 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 		 217 aa  439  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.699616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5120  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  92.63 
 
 		 217 aa  365  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.39 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0681  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.53 
 
 		 215 aa  170  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  43.27 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.68 
 
 		 220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1906  plasmid partitioning-family protein  36.57 
 
 		 240 aa  128  8.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.45 
 
 		 241 aa  116  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6419  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.02 
 
 		 221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.997176 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3356  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.95 
 
 		 211 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1481  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.76 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.111324 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.8 
 
 		 219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.858877  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.15 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1482  ParA family protein  32.02 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.184868 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.15 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.78 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.7 
 
 		 229 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3460  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.99 
 
 		 216 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.81 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.83 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5757  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.17 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 		 229 aa  105  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.94 
 
 		 229 aa  104  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2637  ParA-like protein  37.44 
 
 		 203 aa  104  9e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.367255  normal  0.182137 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3124  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.47 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0597611 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2166  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  33.49 
 
 		 309 aa  102  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.443224  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  34.16 
 
 		 209 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0077  hypothetical protein  33.04 
 
 		 267 aa  101  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.228977 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2220  ParA family partition protein  35.55 
 
 		 250 aa  98.2  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.04 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.73 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1451  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 		 226 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  30.73 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2455  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.95 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0078  hypothetical protein  30.88 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.291271 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.13 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.16 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1510  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.95 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2882  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4611  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.52 
 
 		 224 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187425  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3553  hypothetical protein  31.51 
 
 		 217 aa  89  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.66 
 
 		 207 aa  88.2  9e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6807  ATPase, ParA type  30.95 
 
 		 225 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.739325 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5587  hypothetical protein  31.86 
 
 		 217 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.895248  normal  0.0278536 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.85 
 
 		 212 aa  86.7  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3840  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.99 
 
 		 226 aa  85.5  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.85 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  36.36 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4482  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.68 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.41765 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.65 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.88 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0047  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.5 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.41 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1978  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.96 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  29 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.82 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.37 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.98 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  31.6 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.68 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.28 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.73 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.65 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1769  hypothetical protein  29.06 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.00507269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.4 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  25.57 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.02 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.503731  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.68 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2325  hypothetical protein  29.85 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.338387  normal  0.476496 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  31.88 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.49 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.29 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.59 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0832  partition protein A  28.36 
 
 		 182 aa  74.3  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4687  ParA protein, putative  30.2 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0061  parA protein, putative  30.2 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0653211  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.73 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.07 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4349  ParA protein, putative  30.2 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.108838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.16 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5279  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.96 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.07 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.05 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.16 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.67 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.16 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.16 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.16 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.16 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8771  chromosome partitioning ATPase  30.74 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6491  ParA protein, putative  31.88 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1953  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.35 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.41 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.92 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.34 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.05 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  31.51 
 
 		 212 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.34 
 
 		 212 aa  72  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>