More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0832 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0832  partition protein A  100 
 
 
182 aa  367  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20580  hypothetical protein  36.26 
 
 
215 aa  96.3  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.91305  normal  0.247088 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.77 
 
 
212 aa  72  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.29 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.33 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2220  ParA family partition protein  28.57 
 
 
250 aa  67.8  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.52 
 
 
231 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.52 
 
 
231 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.86 
 
 
212 aa  67.8  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.52 
 
 
231 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.4 
 
 
217 aa  67.8  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.6 
 
 
217 aa  67.8  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.52 
 
 
231 aa  67  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.52 
 
 
231 aa  67  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.52 
 
 
231 aa  67  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.78 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.78 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.9 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.18 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.503731  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.29 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.4 
 
 
219 aa  64.3  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.14 
 
 
212 aa  64.3  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.45 
 
 
234 aa  63.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.44 
 
 
217 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  26.64 
 
 
220 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.71 
 
 
214 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.44 
 
 
217 aa  63.2  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3289  ParA family protein  25.7 
 
 
220 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000336314  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2114  ParA family protein  25.7 
 
 
220 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579771  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1503  ParA family protein  25.7 
 
 
220 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000197714  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.17 
 
 
220 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3176  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  25.7 
 
 
220 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00741579  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1422  ParA family protein  25.7 
 
 
220 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000341933  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.64 
 
 
220 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2409  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  25.7 
 
 
220 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.17 
 
 
220 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.64 
 
 
220 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1143  ParA family protein  25.7 
 
 
220 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661225  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.17 
 
 
220 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.17 
 
 
220 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.64 
 
 
220 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.83 
 
 
212 aa  62.4  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.32 
 
 
212 aa  62  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.21 
 
 
207 aa  62.4  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.74 
 
 
212 aa  62  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.71 
 
 
211 aa  61.6  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1978  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.47 
 
 
211 aa  61.6  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.85 
 
 
212 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.83 
 
 
212 aa  61.2  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.34 
 
 
212 aa  61.2  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  27.92 
 
 
207 aa  61.2  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.83 
 
 
212 aa  60.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.83 
 
 
212 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.83 
 
 
212 aa  60.5  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  26.73 
 
 
223 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.2 
 
 
209 aa  60.5  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.88 
 
 
220 aa  60.1  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.32 
 
 
212 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.83 
 
 
212 aa  59.7  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.32 
 
 
212 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.83 
 
 
212 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.47 
 
 
212 aa  59.7  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.27 
 
 
212 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.66 
 
 
217 aa  59.3  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  26.83 
 
 
212 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.83 
 
 
212 aa  59.3  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.05 
 
 
217 aa  58.9  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.15 
 
 
229 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.22 
 
 
232 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.64 
 
 
215 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.15 
 
 
229 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  24.88 
 
 
220 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.22 
 
 
232 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.34 
 
 
212 aa  58.5  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.91 
 
 
222 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  29.05 
 
 
212 aa  58.2  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.76 
 
 
220 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2068  putative partition-related protein  24.06 
 
 
210 aa  58.2  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4151  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.83 
 
 
220 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0189  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.76 
 
 
235 aa  57.8  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  26.83 
 
 
220 aa  57.8  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.64 
 
 
229 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.85 
 
 
212 aa  57  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0009  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.77 
 
 
211 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.363565  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.42 
 
 
211 aa  57.4  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.27 
 
 
232 aa  56.6  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1153  putative partition-related protein  28.88 
 
 
206 aa  56.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  27.88 
 
 
212 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.34 
 
 
212 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  25.41 
 
 
201 aa  55.8  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1680  hypothetical protein  29.27 
 
 
211 aa  55.5  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.679008  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.22 
 
 
217 aa  55.8  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.699616  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1378  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.27 
 
 
211 aa  55.5  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.626674  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.43 
 
 
210 aa  55.1  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3304  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.75 
 
 
223 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  27.09 
 
 
212 aa  55.1  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.84 
 
 
241 aa  54.7  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.18 
 
 
224 aa  53.9  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2449  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.54 
 
 
219 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0538918  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.37 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>