More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0009 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0009  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
211 aa  430  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.363565  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0189  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.79 
 
 
235 aa  156  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1153  putative partition-related protein  41.79 
 
 
206 aa  150  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2068  putative partition-related protein  37.75 
 
 
210 aa  144  9e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0550  putative partition-related protein  37.68 
 
 
208 aa  142  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.840811 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3113  hypothetical protein  37.93 
 
 
208 aa  142  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0805  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.5 
 
 
206 aa  139  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.50757e-20  unclonable  0.0000000618537 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2389  putative partition-related protein  38.31 
 
 
217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467103 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0850  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.75 
 
 
219 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.668174  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5775  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.76 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2491  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.76 
 
 
219 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.926396  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2359  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.76 
 
 
219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723291  normal  0.455428 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.83 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0846  ParA family protein  37.25 
 
 
207 aa  132  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.89485  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0699  ParA family protein  37.25 
 
 
207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2314  ParA family protein  37.25 
 
 
207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0184356  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1047  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  37.25 
 
 
207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.4276  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2973  ParA family protein  37.25 
 
 
207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510642  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1041  ParA family protein  37.25 
 
 
207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1626  ParA family protein  37.25 
 
 
207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00224937  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2777  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.58 
 
 
220 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.84936 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1202  ParA family protein  37.25 
 
 
331 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2449  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.27 
 
 
219 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0538918  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.27 
 
 
219 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2444  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.27 
 
 
219 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1008  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.36 
 
 
212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1875  ParA-like protein  35.78 
 
 
212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2197  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.23 
 
 
221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.139506 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1550  putative partition-related protein  35.78 
 
 
212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131235 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2655  putative partition-related protein  36.23 
 
 
221 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.634269 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2866  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.38 
 
 
206 aa  129  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4398  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.27 
 
 
206 aa  129  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.38 
 
 
206 aa  129  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110983  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3490  ParA family ATPase  35.78 
 
 
212 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2199  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.62 
 
 
234 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.685518 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  36.27 
 
 
201 aa  123  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0431  partition protein  34.12 
 
 
213 aa  121  7e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03580  partition protein  32.71 
 
 
210 aa  121  8e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.6 
 
 
213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.572043  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1675  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.31 
 
 
205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0098  partition protein  33.94 
 
 
209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10243  normal  0.0389744 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0391  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.87 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000118454  unclonable  0.000000000458103 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1239  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
205 aa  113  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1298  putative partition-related protein  35.27 
 
 
224 aa  113  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150444 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3136  putative partition-related protein  34.8 
 
 
209 aa  105  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0178894  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.73 
 
 
212 aa  95.1  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.51 
 
 
209 aa  91.3  9e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02473  hypothetical protein  33.1 
 
 
222 aa  90.5  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.86 
 
 
222 aa  89  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  34.01 
 
 
209 aa  89  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.37 
 
 
217 aa  89  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0205  putative partitioning protein ParA  26.29 
 
 
246 aa  89  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.34 
 
 
214 aa  88.6  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.72 
 
 
212 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.31 
 
 
212 aa  85.5  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.2 
 
 
212 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.73 
 
 
212 aa  85.1  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.16 
 
 
211 aa  84.7  8e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.2 
 
 
212 aa  84.7  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.92 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.72 
 
 
217 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.72 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.92 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  39.52 
 
 
212 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.52 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.52 
 
 
212 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.51 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.92 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  38.92 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.31 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.72 
 
 
212 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.72 
 
 
212 aa  82.4  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.72 
 
 
212 aa  82.4  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.72 
 
 
212 aa  82.4  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.53 
 
 
210 aa  82  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.32 
 
 
212 aa  82  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  36.27 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.69 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38 
 
 
217 aa  81.3  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38 
 
 
217 aa  81.3  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.69 
 
 
212 aa  81.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.89 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.5 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.5 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.5 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2330  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.94 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.5 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.5 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0183  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
221 aa  79.7  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150447  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.51 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.19 
 
 
217 aa  79  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.2 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.13 
 
 
212 aa  79  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.37 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.19 
 
 
217 aa  78.2  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 
231 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.79 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1978  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.02 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.1 
 
 
211 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>