More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3388 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
229 aa  471  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  99.56 
 
 
229 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  97.38 
 
 
229 aa  461  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  91.08 
 
 
215 aa  403  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0077  hypothetical protein  45.5 
 
 
267 aa  170  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.228977 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2220  ParA family partition protein  45.28 
 
 
250 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0078  hypothetical protein  41.15 
 
 
249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.291271 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1906  plasmid partitioning-family protein  34.12 
 
 
240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4482  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.82 
 
 
240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.41765 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35 
 
 
214 aa  126  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.65 
 
 
241 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.99 
 
 
219 aa  111  9e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.858877  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1481  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.98 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.111324 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.15 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2166  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  31.6 
 
 
309 aa  109  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.443224  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1482  ParA family protein  31.19 
 
 
221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.184868 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3356  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.48 
 
 
211 aa  104  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  30.7 
 
 
223 aa  104  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.16 
 
 
220 aa  101  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.33 
 
 
234 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0681  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.99 
 
 
215 aa  99.8  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1510  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.65 
 
 
226 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.35 
 
 
216 aa  99.4  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4611  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.12 
 
 
224 aa  99.4  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187425  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6807  ATPase, ParA type  33.18 
 
 
225 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.739325 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3840  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.65 
 
 
226 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1451  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.65 
 
 
226 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2882  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.33 
 
 
226 aa  96.7  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2455  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.28 
 
 
226 aa  95.9  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5757  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.86 
 
 
215 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3460  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 
216 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5120  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.72 
 
 
217 aa  90.1  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3124  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.73 
 
 
216 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0597611 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.4 
 
 
212 aa  89.4  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6419  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.9 
 
 
221 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.997176 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3553  hypothetical protein  30.23 
 
 
217 aa  87.4  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.67 
 
 
217 aa  84.3  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.699616  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
213 aa  84.7  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5587  hypothetical protein  30.39 
 
 
217 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.895248  normal  0.0278536 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2637  ParA-like protein  32.86 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.367255  normal  0.182137 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.79 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03280  parA family protein  33.51 
 
 
231 aa  78.2  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.51 
 
 
209 aa  78.2  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  31 
 
 
207 aa  76.6  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0008  plasmid partition protein A, putative  31.31 
 
 
219 aa  75.5  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745248  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.65 
 
 
207 aa  74.7  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.69 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0032  putative plasmid partition protein A  30.84 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0137071  normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.75 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.54 
 
 
217 aa  72  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  31.5 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  25.23 
 
 
222 aa  71.6  0.000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  36 
 
 
201 aa  71.2  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.59 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.59 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1769  hypothetical protein  30.85 
 
 
222 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.00507269 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  33.33 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.65 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  29.81 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.28 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.54 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.01 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2325  hypothetical protein  29.35 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.338387  normal  0.476496 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.92 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.28 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.01 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2122  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  34.96 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.617804  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2879  hypothetical protein  28.36 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187633  hitchhiker  0.00000000100318 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.94 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.94 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1535  hypothetical protein  28.24 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.295146 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.94 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.33 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0047  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.31 
 
 
209 aa  68.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.3 
 
 
217 aa  67.8  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.1 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.19 
 
 
234 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.503731  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.13 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1281  hypothetical protein  28.64 
 
 
247 aa  67  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5279  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.17 
 
 
213 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0021  hypothetical protein  30.37 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0145504  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  29.13 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.11 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1377  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.5 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.28 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.12 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  27.14 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3289  ParA family protein  28.29 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000336314  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2114  ParA family protein  28.29 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579771  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1503  ParA family protein  28.29 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000197714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1422  ParA family protein  28.29 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000341933  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  28.71 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2409  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  28.29 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1143  ParA family protein  28.29 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661225  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3176  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  28.29 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00741579  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1422  hypothetical protein  27.64 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.5 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.5 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.08 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0025  para protein  27.03 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00204905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>