More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3515 on replicon NC_009469
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009469  Acry_3515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 		 219 aa  447  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.858877  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.12 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.5 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  35.78 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.88 
 
 		 215 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0681  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37 
 
 		 215 aa  112  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.99 
 
 		 229 aa  111  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.99 
 
 		 229 aa  111  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.84 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6419  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.54 
 
 		 221 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.997176 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2882  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.93 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2455  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.36 
 
 		 226 aa  96.3  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.07 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1481  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.92 
 
 		 223 aa  96.3  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.111324 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5120  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.93 
 
 		 217 aa  94.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1906  plasmid partitioning-family protein  31.4 
 
 		 240 aa  94.4  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2166  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  31.4 
 
 		 309 aa  93.2  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.443224  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4611  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.22 
 
 		 224 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187425  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0078  hypothetical protein  33.48 
 
 		 249 aa  92  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.291271 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3460  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.92 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2637  ParA-like protein  37.44 
 
 		 203 aa  90.5  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.367255  normal  0.182137 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3840  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.77 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.8 
 
 		 217 aa  90.5  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.699616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0077  hypothetical protein  32.21 
 
 		 267 aa  90.1  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.228977 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1510  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.82 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1451  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.77 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.92 
 
 		 241 aa  89  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3356  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.88 
 
 		 211 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6807  ATPase, ParA type  31.94 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.739325 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3124  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.39 
 
 		 216 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0597611 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5757  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.95 
 
 		 215 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.78 
 
 		 234 aa  86.3  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  31.13 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.13 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2220  ParA family partition protein  30.62 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1482  ParA family protein  31.58 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.184868 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.7 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3553  hypothetical protein  32.02 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.98 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6491  ParA protein, putative  30 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  32.26 
 
 		 211 aa  72  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5587  hypothetical protein  30.59 
 
 		 217 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.895248  normal  0.0278536 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.05 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4482  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.29 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.41765 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.8 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0108  hypothetical protein  39.29 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.327497  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.06 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9384  chromosome partitioning protein; transcriptional regulator  27.16 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.58 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.58 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4668  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.72 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016966  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03280  parA family protein  32.43 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1680  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.82 
 
 		 241 aa  65.1  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0266407  hitchhiker  0.00479585 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1769  hypothetical protein  29.81 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.00507269 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.62 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  25.94 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.67 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.78 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.14 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1953  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.05 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  31.75 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0045  Slp  28.82 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.014209  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2325  hypothetical protein  31.13 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.338387  normal  0.476496 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3589  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.61 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.1 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.58 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.11 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.1 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.06 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.41 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.14 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.23 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.49 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  28 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.9 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.29 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  29.25 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.58 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.62 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.21 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.94 
 
 		 217 aa  62  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.94 
 
 		 217 aa  62  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.72 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0355  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.5 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  31.22 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  26.47 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.47 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.95 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.21 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.62 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4960  hypothetical protein  30.98 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5389  hypothetical protein  30.98 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.14 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2879  hypothetical protein  29.81 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187633  hitchhiker  0.00000000100318 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1585  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.27 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0495676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.62 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1864  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.27 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.238573  normal  0.0904624 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.02 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  24.19 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>