More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1590 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 		 211 aa  416  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 		 211 aa  416  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  67.62 
 
 		 211 aa  264  7e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.12 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0047  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.06 
 
 		 209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.21 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.21 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  33.49 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.21 
 
 		 217 aa  104  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.2 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.68 
 
 		 232 aa  102  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.75 
 
 		 217 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.16 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.01 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.47 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.1 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.23 
 
 		 217 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.64 
 
 		 209 aa  99.4  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.64 
 
 		 212 aa  99  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.95 
 
 		 209 aa  98.6  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.75 
 
 		 212 aa  98.6  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.76 
 
 		 222 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.58 
 
 		 212 aa  98.6  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3684  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 216 aa  97.8  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.444567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.13 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2166  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  34.65 
 
 		 309 aa  97.8  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.443224  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.82 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.8 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.1 
 
 		 212 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.65 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.44 
 
 		 212 aa  96.3  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1906  plasmid partitioning-family protein  33.81 
 
 		 240 aa  95.1  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.19 
 
 		 231 aa  94.7  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.84 
 
 		 232 aa  95.1  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.19 
 
 		 231 aa  94.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.84 
 
 		 232 aa  95.1  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.19 
 
 		 231 aa  94.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.19 
 
 		 231 aa  94.7  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.1 
 
 		 212 aa  94.7  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.1 
 
 		 212 aa  94  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.58 
 
 		 212 aa  94  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.1 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.19 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.54 
 
 		 212 aa  93.2  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.62 
 
 		 212 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.1 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.19 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.73 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  36.36 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.27 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.13 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5082  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.92 
 
 		 227 aa  92.4  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.161986 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.13 
 
 		 212 aa  92.8  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.62 
 
 		 212 aa  92  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.62 
 
 		 212 aa  92  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  34.13 
 
 		 212 aa  91.7  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  34.62 
 
 		 212 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.13 
 
 		 212 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.96 
 
 		 217 aa  91.3  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.5 
 
 		 217 aa  91.3  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.33 
 
 		 212 aa  90.5  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.18 
 
 		 220 aa  89.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.49 
 
 		 220 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  30.14 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.17 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.18 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  33.33 
 
 		 220 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.65 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.18 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.18 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.49 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.49 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3176  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  29.73 
 
 		 220 aa  89  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00741579  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2114  ParA family protein  29.73 
 
 		 220 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579771  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1143  ParA family protein  29.73 
 
 		 220 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661225  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1503  ParA family protein  29.73 
 
 		 220 aa  89  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000197714  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3289  ParA family protein  29.73 
 
 		 220 aa  89  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000336314  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.29 
 
 		 219 aa  89  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1422  ParA family protein  29.73 
 
 		 220 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000341933  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2409  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  29.73 
 
 		 220 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1510  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.02 
 
 		 226 aa  88.6  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.3 
 
 		 217 aa  88.2  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  33.65 
 
 		 212 aa  88.2  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  31.46 
 
 		 209 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1378  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.14 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.626674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.44 
 
 		 216 aa  87.8  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.44 
 
 		 220 aa  87.4  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1680  hypothetical protein  35.14 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.679008  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4151  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.82 
 
 		 220 aa  87  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.49 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5343  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.49 
 
 		 219 aa  86.7  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0681  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33 
 
 		 215 aa  86.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.82 
 
 		 220 aa  85.5  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.05 
 
 		 234 aa  85.5  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.503731  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  29.02 
 
 		 220 aa  85.5  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.87 
 
 		 252 aa  85.5  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.56 
 
 		 211 aa  85.9  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2220  ParA family partition protein  33.79 
 
 		 250 aa  84.7  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1978  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.9 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.4 
 
 		 211 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>