248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3113 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3113  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  427  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0009  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.93 
 
 		 211 aa  142  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.363565  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3490  ParA family ATPase  36.1 
 
 		 212 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1008  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.61 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3136  putative partition-related protein  38.42 
 
 		 209 aa  125  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0178894  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2389  putative partition-related protein  38.19 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467103 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0699  ParA family protein  35.12 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1626  ParA family protein  35.12 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00224937  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1047  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  35.12 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.4276  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2777  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.76 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.84936 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1041  ParA family protein  35.12 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2314  ParA family protein  35.12 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0184356  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2973  ParA family protein  35.12 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510642  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0805  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.59 
 
 		 206 aa  122  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.50757e-20  unclonable  0.0000000618537 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0846  ParA family protein  34.63 
 
 		 207 aa  122  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.89485  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2655  putative partition-related protein  35.68 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.634269 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1202  ParA family protein  35.12 
 
 		 331 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2197  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.68 
 
 		 221 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.139506 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0550  putative partition-related protein  33.33 
 
 		 208 aa  121  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.840811 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2068  putative partition-related protein  34.48 
 
 		 210 aa  121  8e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2199  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.8 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.685518 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5775  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.15 
 
 		 222 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.2 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1153  putative partition-related protein  35.82 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2359  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.15 
 
 		 219 aa  118  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723291  normal  0.455428 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0850  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.63 
 
 		 219 aa  118  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.668174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2491  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.15 
 
 		 219 aa  118  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.926396  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2449  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.15 
 
 		 219 aa  117  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0538918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.15 
 
 		 219 aa  117  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2444  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.15 
 
 		 219 aa  117  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1675  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.45 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4398  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.23 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0391  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.65 
 
 		 264 aa  115  5e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000118454  unclonable  0.000000000458103 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2866  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.71 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.71 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1298  putative partition-related protein  35.87 
 
 		 224 aa  113  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150444 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0189  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.54 
 
 		 235 aa  112  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  34.48 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0098  partition protein  33.82 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10243  normal  0.0389744 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1239  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 205 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1550  putative partition-related protein  33 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131235 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1875  ParA-like protein  33 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03580  partition protein  30.92 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0431  partition protein  30.48 
 
 		 213 aa  92.8  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.48 
 
 		 213 aa  92  6e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.572043  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0205  putative partitioning protein ParA  23.9 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.98 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02473  hypothetical protein  25.95 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.11 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.45 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  30.12 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.89 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1978  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.59 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.64 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.15 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.64 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.63 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.92 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.79 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  23.56 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1680  hypothetical protein  26.88 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.679008  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0003  partition protein  27.78 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000179256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3315  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.67 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.54 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.01 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1378  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.88 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.626674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.54 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.23 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.83 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.81 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.56 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.51 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.81 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0183  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.31 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150447  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4271  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.21 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.323978  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.93 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.93 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5082  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.06 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.161986 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.93 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.08 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.23 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.93 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.64 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.46 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.93 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.51 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.93 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  23.04 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.51 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4151  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.79 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.48 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.51 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.1 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4554  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.07 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.1 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2114  ParA family protein  23.04 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579771  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1345  hypothetical protein  25.54 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>