192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0779 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0779  chromosome partitioning ATPase  100 
 
 
231 aa  481  1e-135  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.352348  normal  0.0863707 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1345  hypothetical protein  65.65 
 
 
227 aa  316  2e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1410  hypothetical protein  59.13 
 
 
223 aa  259  3e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.499292  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01091  hypothetical protein  59.13 
 
 
223 aa  259  3e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.535106  normal  0.920257 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06541  chromosome partitioning ATPase protein  57.84 
 
 
223 aa  251  6e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.849142  normal  0.485277 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00581  chromosome partitioning ATPase protein  56.25 
 
 
223 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.214222  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1091  hypothetical protein  62.35 
 
 
184 aa  225  5.0000000000000005e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.249666  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0052  hypothetical protein  53.42 
 
 
221 aa  223  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00611  chromosome partitioning ATPase protein  54.9 
 
 
223 aa  221  6e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00591  chromosome partitioning ATPase protein  55.22 
 
 
223 aa  220  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0821  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.76 
 
 
196 aa  118  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.051634 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2658  hypothetical protein  32.34 
 
 
195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3446  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.34 
 
 
195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4881  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.51 
 
 
212 aa  108  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270203  hitchhiker  0.000435633 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4554  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.85 
 
 
196 aa  98.6  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1536  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.12 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.116113  normal  0.228673 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0860  ParA family chromosome partitioning ATPase  30.39 
 
 
219 aa  72  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3315  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.1 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3304  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.62 
 
 
223 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28 
 
 
220 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.36 
 
 
220 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.36 
 
 
220 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.36 
 
 
220 aa  62  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29 
 
 
220 aa  62  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.78 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  27.78 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5598  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.9 
 
 
192 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000000765743  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  27.64 
 
 
220 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.64 
 
 
220 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.64 
 
 
220 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2114  ParA family protein  27.14 
 
 
220 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579771  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1503  ParA family protein  27.14 
 
 
220 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000197714  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4151  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.64 
 
 
220 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1143  ParA family protein  27.14 
 
 
220 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661225  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1422  ParA family protein  27.14 
 
 
220 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000341933  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3289  ParA family protein  27.14 
 
 
220 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000336314  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3176  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  27.14 
 
 
220 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00741579  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2409  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  27.14 
 
 
220 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6252  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  27.47 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0236598  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.51 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.06 
 
 
217 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1305  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.51 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.153977  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  33.33 
 
 
207 aa  54.3  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.84 
 
 
217 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.93 
 
 
217 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6875  ATPases involved in chromosome partitioning-like protein  27.46 
 
 
223 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.11 
 
 
212 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.09 
 
 
209 aa  54.3  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_08  DNA-binding protein, putative plasmid partition protein  21.31 
 
 
211 aa  53.5  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0411  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.88 
 
 
194 aa  53.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.23 
 
 
212 aa  52.8  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.1 
 
 
217 aa  52.4  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.27 
 
 
212 aa  52.4  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.52 
 
 
207 aa  52  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0098  partition protein  30.43 
 
 
209 aa  52  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10243  normal  0.0389744 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.62 
 
 
234 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.503731  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.67 
 
 
210 aa  50.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.31 
 
 
224 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.21 
 
 
231 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  25.65 
 
 
220 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2068  putative partition-related protein  27.54 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03580  partition protein  27.64 
 
 
210 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5819  plasmid partitioning ATPase  23.28 
 
 
218 aa  49.7  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.07 
 
 
212 aa  49.3  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.21 
 
 
231 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5343  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.28 
 
 
219 aa  49.3  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.21 
 
 
231 aa  49.3  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.34 
 
 
222 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.79 
 
 
212 aa  49.3  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.21 
 
 
231 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.21 
 
 
231 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.21 
 
 
231 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.21 
 
 
231 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0846  ParA family protein  30.12 
 
 
207 aa  48.9  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.89485  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2552  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.94 
 
 
312 aa  48.9  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000741999  normal  0.352702 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.17 
 
 
213 aa  48.5  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.572043  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0699  ParA family protein  30.12 
 
 
207 aa  48.5  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2314  ParA family protein  30.12 
 
 
207 aa  48.5  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0184356  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.02 
 
 
217 aa  48.5  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2973  ParA family protein  30.12 
 
 
207 aa  48.5  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510642  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1041  ParA family protein  30.12 
 
 
207 aa  48.5  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1047  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  30.12 
 
 
207 aa  48.5  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.4276  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1626  ParA family protein  30.12 
 
 
207 aa  48.5  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00224937  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0003  partition protein  23.28 
 
 
222 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000179256  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1202  ParA family protein  29.52 
 
 
331 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5043  hypothetical protein  27.34 
 
 
229 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000269108  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.74 
 
 
214 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3903  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.55 
 
 
263 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3896  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.75 
 
 
222 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1239  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.93 
 
 
205 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  25 
 
 
253 aa  47.4  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3783  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.75 
 
 
222 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0208258  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7432  putative partition protein  46.51 
 
 
212 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.529714 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.67 
 
 
255 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.87 
 
 
220 aa  47  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.27 
 
 
219 aa  47  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.3 
 
 
217 aa  47  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0282  hypothetical protein  45.45 
 
 
246 aa  46.2  0.0004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.00050925  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1033  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.78 
 
 
276 aa  46.6  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0985734  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5278  stability/partitioning determinant  25.17 
 
 
228 aa  45.4  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.918296  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>