217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1345 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1345  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  469  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0779  chromosome partitioning ATPase  65.65 
 
 
231 aa  316  2e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.352348  normal  0.0863707 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06541  chromosome partitioning ATPase protein  59.51 
 
 
223 aa  247  8e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.849142  normal  0.485277 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1410  hypothetical protein  57.92 
 
 
223 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.499292  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01091  hypothetical protein  57.92 
 
 
223 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.535106  normal  0.920257 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1091  hypothetical protein  61.9 
 
 
184 aa  217  1e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.249666  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00581  chromosome partitioning ATPase protein  55.12 
 
 
223 aa  213  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.214222  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0052  hypothetical protein  55.12 
 
 
221 aa  210  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00611  chromosome partitioning ATPase protein  55.12 
 
 
223 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00591  chromosome partitioning ATPase protein  55.12 
 
 
223 aa  208  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0821  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.83 
 
 
196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.051634 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3446  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.1 
 
 
195 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2658  hypothetical protein  34.1 
 
 
195 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4554  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32 
 
 
196 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4881  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
212 aa  95.9  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270203  hitchhiker  0.000435633 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1536  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.65 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.116113  normal  0.228673 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0860  ParA family chromosome partitioning ATPase  31.79 
 
 
219 aa  72.4  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3315  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.74 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5598  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.41 
 
 
192 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000000765743  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.43 
 
 
217 aa  60.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.05 
 
 
212 aa  58.9  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.48 
 
 
220 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.4 
 
 
217 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.57 
 
 
220 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.57 
 
 
220 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.57 
 
 
220 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4151  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.06 
 
 
220 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03580  partition protein  34.19 
 
 
210 aa  57.4  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  28.65 
 
 
220 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0098  partition protein  32.43 
 
 
209 aa  56.6  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10243  normal  0.0389744 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.31 
 
 
212 aa  55.8  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.65 
 
 
220 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3304  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.08 
 
 
223 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  26.03 
 
 
220 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.3 
 
 
217 aa  55.5  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5278  stability/partitioning determinant  29.57 
 
 
228 aa  55.5  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.918296  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.65 
 
 
212 aa  55.5  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.19 
 
 
212 aa  55.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2409  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  26.03 
 
 
220 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2114  ParA family protein  26.03 
 
 
220 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579771  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1503  ParA family protein  26.03 
 
 
220 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000197714  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.03 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5043  hypothetical protein  28.98 
 
 
229 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000269108  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.03 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3176  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  26.03 
 
 
220 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00741579  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.03 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1143  ParA family protein  26.03 
 
 
220 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661225  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1422  ParA family protein  26.03 
 
 
220 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000341933  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3289  ParA family protein  26.03 
 
 
220 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000336314  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3113  hypothetical protein  25.54 
 
 
208 aa  53.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.61 
 
 
234 aa  53.1  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.503731  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7432  putative partition protein  46.94 
 
 
212 aa  52.8  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.529714 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.83 
 
 
212 aa  52.8  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.94 
 
 
214 aa  52.8  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_08  DNA-binding protein, putative plasmid partition protein  23.72 
 
 
211 aa  52.4  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.79 
 
 
217 aa  52.4  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.8 
 
 
224 aa  52.4  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.04 
 
 
223 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1305  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.04 
 
 
223 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.153977  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0411  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.17 
 
 
194 aa  52  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  27.18 
 
 
220 aa  51.6  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2068  putative partition-related protein  33.68 
 
 
210 aa  51.2  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.82 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.02 
 
 
210 aa  50.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.52 
 
 
207 aa  50.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.87 
 
 
209 aa  50.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.13 
 
 
217 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6252  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  25.33 
 
 
223 aa  50.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0236598  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1033  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.9 
 
 
276 aa  50.1  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0985734  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.89 
 
 
231 aa  49.3  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0846  ParA family protein  28.03 
 
 
207 aa  49.3  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.89485  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.89 
 
 
231 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.89 
 
 
231 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.52 
 
 
213 aa  49.3  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.572043  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.89 
 
 
231 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  28.08 
 
 
253 aa  49.3  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.89 
 
 
231 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.89 
 
 
231 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.89 
 
 
231 aa  48.9  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.41 
 
 
217 aa  48.9  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0699  ParA family protein  28.03 
 
 
207 aa  48.5  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5343  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.74 
 
 
219 aa  48.5  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1626  ParA family protein  28.03 
 
 
207 aa  48.5  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00224937  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1047  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  28.03 
 
 
207 aa  48.5  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.4276  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2314  ParA family protein  28.03 
 
 
207 aa  48.5  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0184356  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2973  ParA family protein  28.03 
 
 
207 aa  48.5  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510642  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0431  partition protein  26.85 
 
 
213 aa  48.5  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1041  ParA family protein  28.03 
 
 
207 aa  48.5  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02473  hypothetical protein  25.64 
 
 
222 aa  48.5  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.08 
 
 
212 aa  48.5  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  28.03 
 
 
207 aa  48.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2359  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.48 
 
 
219 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723291  normal  0.455428 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0009  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 
211 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.363565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1202  ParA family protein  28.03 
 
 
331 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.03 
 
 
217 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2199  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.11 
 
 
234 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.685518 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  26.2 
 
 
209 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5775  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.85 
 
 
222 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3490  ParA family ATPase  28.48 
 
 
212 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2777  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.68 
 
 
220 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.84936 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>