More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4271 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4271  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 		 229 aa  470  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.323978  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  94.71 
 
 		 251 aa  447  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.6 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.6 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.6 
 
 		 231 aa  92.4  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.17 
 
 		 231 aa  92  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.17 
 
 		 231 aa  92  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.17 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.17 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2810  ParA protein, putative  30.04 
 
 		 231 aa  90.9  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0568831  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3579  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  31.08 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.299225  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2127  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.7 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2630  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.2 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5598  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.07 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000000765743  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2890  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.33 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9806  chromosome partitioning protein  27.98 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.8 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.8 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4164  hypothetical protein  27.8 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0393565  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1536  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.94 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.116113  normal  0.228673 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4303  chromosome partitioning protein  29.02 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5170  ParA protein, putative  27.08 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.433255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.26 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0704  chromosome partitioning protein  29.46 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.13 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.3 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.88 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.39 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.27 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.39 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.35 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6491  ParA protein, putative  29.38 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6380  hypothetical protein  25.74 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3315  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.32 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.98 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.52 
 
 		 217 aa  72  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.3 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6226  chromosome partitioning ATPase  25.74 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.307356 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3304  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.89 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.94 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.65 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.21 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.32 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1305  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.32 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.153977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5433  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.3 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.04 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.04 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8771  chromosome partitioning ATPase  28.71 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.04 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.52 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0061  parA protein, putative  27.12 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0653211  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4687  ParA protein, putative  25.96 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.15 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.34 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4349  ParA protein, putative  25.96 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.108838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  34.78 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1033  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.8 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0985734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2068  putative partition-related protein  32.39 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  31.54 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4261  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.44 
 
 		 193 aa  67  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4551  hypothetical protein  27.15 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  25.79 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.36 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.16 
 
 		 265 aa  65.1  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.34 
 
 		 211 aa  65.1  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.34 
 
 		 211 aa  65.1  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.16 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0283  putative partition protein ParA  26.47 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2882  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.86 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0355  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.52 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.39 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  32.93 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.16 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.78 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.31 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  29.82 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2455  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.59 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2816  plasmid partition protein ParA-like  28.95 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.284483  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.16 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3840  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.85 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  35.16 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6807  ATPase, ParA type  34.13 
 
 		 225 aa  62  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.739325 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0391  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.08 
 
 		 264 aa  62  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000118454  unclonable  0.000000000458103 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4611  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.88 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187425  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.04 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.77 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  26.67 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.59 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.16 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.91 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0386  chromosome partitioning ATPase  31.07 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.136541  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.16 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  36.09 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1978  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.02 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.16 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.49 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.16 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  29.85 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.16 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>