More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4525 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007960  Nham_4525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
251 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4271  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  94.71 
 
 
229 aa  447  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.323978  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.68 
 
 
231 aa  86.3  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2810  ParA protein, putative  29.15 
 
 
231 aa  85.9  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0568831  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.68 
 
 
231 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.68 
 
 
231 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.68 
 
 
231 aa  85.9  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.68 
 
 
231 aa  85.9  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.22 
 
 
231 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.22 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2630  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.6 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2890  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.73 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5170  ParA protein, putative  26.88 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.433255  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.7 
 
 
232 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.7 
 
 
232 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1536  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.62 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.116113  normal  0.228673 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4303  chromosome partitioning protein  29.41 
 
 
252 aa  79  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2127  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.3 
 
 
238 aa  78.6  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5598  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
192 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000000765743  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.73 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3315  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.29 
 
 
223 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3579  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  30.18 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.299225  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9806  chromosome partitioning protein  28.37 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.83 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.32 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.39 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8771  chromosome partitioning ATPase  29.8 
 
 
226 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.84 
 
 
211 aa  74.7  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.31 
 
 
210 aa  74.7  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6226  chromosome partitioning ATPase  26.73 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.307356 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.52 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.22 
 
 
217 aa  73.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.22 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.64 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4164  hypothetical protein  27.16 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0393565  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.64 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.49 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6491  ParA protein, putative  27.27 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0704  chromosome partitioning protein  28.05 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0061  parA protein, putative  28.09 
 
 
228 aa  72  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0653211  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4349  ParA protein, putative  27.66 
 
 
228 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.108838  normal 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4687  ParA protein, putative  27.66 
 
 
228 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6380  hypothetical protein  25.31 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.65 
 
 
217 aa  71.6  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.15 
 
 
223 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.1 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1305  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.15 
 
 
223 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.153977  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.15 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.29 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.38 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3304  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.89 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  33.87 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.78 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.71 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.78 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2068  putative partition-related protein  34.51 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4261  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.9 
 
 
193 aa  68.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5433  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.84 
 
 
228 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1033  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.01 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0985734  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  24.55 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  29.19 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0355  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.75 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4551  hypothetical protein  28.14 
 
 
237 aa  65.1  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.34 
 
 
211 aa  64.7  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.34 
 
 
211 aa  64.7  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.38 
 
 
212 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.77 
 
 
206 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1978  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.83 
 
 
211 aa  63.5  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3136  putative partition-related protein  32.76 
 
 
209 aa  63.9  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0178894  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.13 
 
 
209 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.38 
 
 
212 aa  63.5  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.02 
 
 
232 aa  63.2  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 
211 aa  63.2  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.04 
 
 
207 aa  63.2  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.21 
 
 
212 aa  62.8  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  33.54 
 
 
276 aa  62.8  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  30.22 
 
 
223 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0391  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.08 
 
 
264 aa  62.8  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000118454  unclonable  0.000000000458103 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  34.38 
 
 
212 aa  62.4  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.38 
 
 
212 aa  62.4  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3490  ParA family ATPase  26.41 
 
 
212 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.38 
 
 
212 aa  62.4  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4611  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.59 
 
 
224 aa  62.4  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187425  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.65 
 
 
265 aa  62  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.38 
 
 
212 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.91 
 
 
216 aa  61.6  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  29.17 
 
 
257 aa  62  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  26.87 
 
 
209 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.49 
 
 
255 aa  60.5  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6807  ATPase, ParA type  32.8 
 
 
225 aa  60.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.739325 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  27.75 
 
 
212 aa  60.5  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  36.84 
 
 
201 aa  60.8  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1680  hypothetical protein  29.28 
 
 
211 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.679008  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.77 
 
 
268 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2816  plasmid partition protein ParA-like  30.61 
 
 
210 aa  60.8  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.284483  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1378  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.28 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.626674  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2882  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.28 
 
 
226 aa  60.5  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  26.67 
 
 
228 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.11 
 
 
264 aa  60.5  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3553  hypothetical protein  29.69 
 
 
217 aa  60.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>