More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4261 on replicon NC_014159
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014159  Tpau_4261  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
193 aa  377  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5598  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.21 
 
 
192 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000000765743  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0386  chromosome partitioning ATPase  36.46 
 
 
197 aa  92.8  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.136541  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0379  chromosome partitioning ATPase  35.68 
 
 
199 aa  90.9  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.347457  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.68 
 
 
217 aa  78.2  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.68 
 
 
217 aa  78.2  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.2 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1829  chromosome partitioning ATPase  33.16 
 
 
278 aa  77  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00367094  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4151  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.04 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.81 
 
 
234 aa  74.7  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.2 
 
 
217 aa  74.3  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.83 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.27 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.29 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  30.39 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.97 
 
 
217 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.71 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.28 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.28 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.71 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.39 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6419  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.18 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.997176 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.28 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  30.39 
 
 
220 aa  72  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.28 
 
 
220 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.28 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.74 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.28 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.54 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2114  ParA family protein  30.39 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579771  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1143  ParA family protein  30.39 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661225  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1503  ParA family protein  30.39 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000197714  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3176  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  30.39 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00741579  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  35.77 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2127  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.89 
 
 
238 aa  69.7  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1422  ParA family protein  30.39 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000341933  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3289  ParA family protein  30.39 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000336314  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2409  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  30.39 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.55 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.9 
 
 
251 aa  68.6  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  33.55 
 
 
211 aa  67.8  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.5 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1906  plasmid partitioning-family protein  33.12 
 
 
240 aa  67.4  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.74 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4271  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.44 
 
 
229 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.323978  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  33.13 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.36 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.36 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  32 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.28 
 
 
216 aa  65.5  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6491  ParA protein, putative  30.37 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2166  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  35.67 
 
 
309 aa  65.5  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.443224  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.21 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.6 
 
 
212 aa  64.3  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.52 
 
 
217 aa  64.7  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  28.25 
 
 
206 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.26 
 
 
211 aa  63.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36 
 
 
212 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0681  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.72 
 
 
215 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.15 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  31.32 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.51 
 
 
210 aa  63.5  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1033  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.22 
 
 
276 aa  63.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0985734  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.12 
 
 
232 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.12 
 
 
232 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.98 
 
 
211 aa  62.4  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1953  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.75 
 
 
187 aa  62.8  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2455  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.09 
 
 
226 aa  62.4  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4303  chromosome partitioning protein  30.98 
 
 
252 aa  62  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4611  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.16 
 
 
224 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187425  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.33 
 
 
220 aa  61.6  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.65 
 
 
234 aa  61.2  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.503731  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3840  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.2 
 
 
226 aa  61.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.85 
 
 
232 aa  60.8  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2330  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36 
 
 
212 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6807  ATPase, ParA type  33.09 
 
 
225 aa  60.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.739325 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3553  hypothetical protein  31.87 
 
 
217 aa  59.7  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36 
 
 
212 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1978  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.72 
 
 
211 aa  59.7  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1451  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.88 
 
 
226 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.14 
 
 
207 aa  60.1  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.12 
 
 
212 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  36.8 
 
 
212 aa  60.5  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.16 
 
 
212 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2882  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.88 
 
 
226 aa  59.7  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1510  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.16 
 
 
226 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5587  hypothetical protein  31.87 
 
 
217 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.895248  normal  0.0278536 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.67 
 
 
212 aa  58.9  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3315  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.09 
 
 
223 aa  58.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36 
 
 
212 aa  58.5  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.89 
 
 
212 aa  58.9  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.65 
 
 
214 aa  58.5  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3356  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.88 
 
 
211 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.56 
 
 
252 aa  58.5  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36 
 
 
212 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36 
 
 
212 aa  58.5  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36 
 
 
212 aa  58.5  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
219 aa  58.2  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.858877  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0098  partition protein  35.42 
 
 
209 aa  58.2  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10243  normal  0.0389744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>