More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4303 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4303  chromosome partitioning protein  100 
 
 		 252 aa  512  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2630  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.64 
 
 		 232 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2890  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.18 
 
 		 237 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2127  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.55 
 
 		 238 aa  247  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2944  ParA chromosome partitioning protein  54.09 
 
 		 238 aa  225  6e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5433  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.37 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3579  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  35.81 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.299225  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8771  chromosome partitioning ATPase  39.29 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0704  chromosome partitioning protein  36.07 
 
 		 224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4687  ParA protein, putative  32.74 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4349  ParA protein, putative  32.74 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.108838  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0061  parA protein, putative  32.3 
 
 		 228 aa  125  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0653211  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2810  ParA protein, putative  33.02 
 
 		 231 aa  115  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0568831  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0283  putative partition protein ParA  33.8 
 
 		 228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5170  ParA protein, putative  27.16 
 
 		 260 aa  99.8  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.433255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  30.94 
 
 		 206 aa  89  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4551  hypothetical protein  28.57 
 
 		 237 aa  86.7  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6491  ParA protein, putative  33.01 
 
 		 219 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.43 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.41 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8214  putative crown gall tumor protein VirC1  31.28 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144693  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.13 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.65 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.52 
 
 		 217 aa  78.2  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.52 
 
 		 217 aa  78.2  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.13 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.13 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.65 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4271  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.02 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.323978  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.68 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.68 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.68 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4164  hypothetical protein  26.05 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0393565  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.78 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.16 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.23 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.84 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.77 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  33.88 
 
 		 220 aa  72  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6380  hypothetical protein  29.35 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.14 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.45 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.23 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.88 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.83 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.22 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.87 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.86 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.31 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9806  chromosome partitioning protein  28.7 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1536  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.15 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.116113  normal  0.228673 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.24 
 
 		 217 aa  68.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.03 
 
 		 217 aa  68.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.61 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5343  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.33 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5598  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.27 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000000765743  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4776  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.73 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.74468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.68 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.2 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.2 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5278  stability/partitioning determinant  27.01 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.918296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02473  hypothetical protein  32.12 
 
 		 222 aa  67  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.6 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.24 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1378  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.98 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.626674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0391  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.75 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000118454  unclonable  0.000000000458103 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1680  hypothetical protein  34.98 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.679008  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.73 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0226442  normal  0.408806 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.8 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5819  plasmid partitioning ATPase  28 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0025  para protein  26.6 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00204905  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.35 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.78 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.503731  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1384  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.05 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.44 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.65 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4261  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.98 
 
 		 193 aa  62  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1829  chromosome partitioning ATPase  33.61 
 
 		 278 aa  62  0.000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00367094  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.2 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  29.21 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1526  parA family protein  24.02 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429591  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3896  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.56 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4111  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000253608  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3783  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.56 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0208258  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0183  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.55 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150447  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3318  chromosome partitioning ATPase protein-like  28.11 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1875  ParA-like protein  32.74 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  27.38 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1550  putative partition-related protein  32.74 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131235 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2913  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.77 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67187  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  34.48 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.77 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.329595  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3045  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.77 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1460  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.77 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4176  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.81 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.08 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.858877  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.4 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000187977 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  27.5 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  32.41 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.82 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>