More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6226 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6226  chromosome partitioning ATPase  100 
 
 
254 aa  522  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.307356 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.73 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4271  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.74 
 
 
229 aa  71.2  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.323978  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  35.48 
 
 
207 aa  64.3  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4248  chromosome partitioning ATPase  28.17 
 
 
222 aa  62.4  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173583  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.06 
 
 
214 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5035  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.98 
 
 
399 aa  59.7  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2122  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  29.85 
 
 
199 aa  60.1  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.617804  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0183  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.41 
 
 
221 aa  59.3  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150447  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.22 
 
 
231 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.22 
 
 
231 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.22 
 
 
231 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  26.67 
 
 
228 aa  58.5  0.00000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.22 
 
 
231 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.22 
 
 
231 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0805  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.95 
 
 
206 aa  58.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.50757e-20  unclonable  0.0000000618537 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3918  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.08 
 
 
401 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.56 
 
 
217 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.22 
 
 
231 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.22 
 
 
231 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6252  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  22.63 
 
 
223 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0236598  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03580  partition protein  33.91 
 
 
210 aa  57.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2890  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.14 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2127  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.59 
 
 
238 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9806  chromosome partitioning protein  28.93 
 
 
233 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.84 
 
 
212 aa  57  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2630  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.14 
 
 
232 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3591  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.1 
 
 
400 aa  56.6  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4955  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50 
 
 
383 aa  56.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.89 
 
 
222 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5043  hypothetical protein  28.57 
 
 
229 aa  56.2  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000269108  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.78 
 
 
288 aa  55.8  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.07 
 
 
209 aa  55.5  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0936  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.08 
 
 
255 aa  55.5  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.114878 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.21 
 
 
213 aa  55.5  0.0000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.572043  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.17 
 
 
253 aa  55.5  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.143789 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  32.03 
 
 
222 aa  55.1  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.07 
 
 
232 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.08 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.07 
 
 
232 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5343  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.58 
 
 
212 aa  54.3  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0095  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54 
 
 
293 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 
211 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 
216 aa  54.7  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  27.98 
 
 
223 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0355  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.64 
 
 
266 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0009  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.98 
 
 
211 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.363565  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5337  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.1 
 
 
401 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684044  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.49 
 
 
284 aa  53.5  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.09 
 
 
212 aa  53.9  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.59 
 
 
207 aa  53.1  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  32.14 
 
 
201 aa  52.8  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.37 
 
 
268 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1153  putative partition-related protein  31.58 
 
 
206 aa  52.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5819  plasmid partitioning ATPase  30 
 
 
218 aa  52.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6380  hypothetical protein  25.71 
 
 
237 aa  52.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0073  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.25 
 
 
249 aa  52.4  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1550  putative partition-related protein  30.05 
 
 
212 aa  52.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131235 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.62 
 
 
217 aa  52.4  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.09 
 
 
217 aa  52.4  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1875  ParA-like protein  30.05 
 
 
212 aa  52.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0003  partition protein  30.28 
 
 
222 aa  52.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000179256  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  28.57 
 
 
212 aa  52.4  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1978  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.5 
 
 
211 aa  52.4  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
217 aa  52  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.84 
 
 
217 aa  52  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.09 
 
 
217 aa  52  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50 
 
 
224 aa  52.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
217 aa  52  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.92 
 
 
212 aa  52  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0189  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.98 
 
 
235 aa  52  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  49.18 
 
 
253 aa  52  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3896  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.36 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  50.94 
 
 
806 aa  51.2  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.26 
 
 
260 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  30.26 
 
 
260 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0368  ParaA family ATPase  26.62 
 
 
289 aa  52  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0141266  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2777  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.94 
 
 
220 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.84936 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0431  partition protein  32.46 
 
 
213 aa  51.6  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.39 
 
 
212 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3783  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.36 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0208258  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6875  ATPases involved in chromosome partitioning-like protein  22.63 
 
 
223 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0098  partition protein  31.86 
 
 
209 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10243  normal  0.0389744 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.6 
 
 
212 aa  50.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0681  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.84 
 
 
215 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0275  ATP-binding protein  26.51 
 
 
295 aa  50.4  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0366  histidinol phosphatase  26.62 
 
 
288 aa  50.8  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00129205  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.34 
 
 
217 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0129  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.23 
 
 
217 aa  50.8  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3569  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.86 
 
 
252 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.00440484 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.46 
 
 
258 aa  50.1  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.94 
 
 
206 aa  50.4  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3200  iron-sulfur cluster-binding/ATPase domain-containing protein  46.81 
 
 
311 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.752938  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.4 
 
 
212 aa  50.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8214  putative crown gall tumor protein VirC1  50 
 
 
231 aa  49.3  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144693  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.23 
 
 
252 aa  49.3  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.82 
 
 
257 aa  49.7  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.83 
 
 
213 aa  49.7  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.89 
 
 
217 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>