More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2789 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2789  ATPase MipZ  100 
 
 		 267 aa  539  9.999999999999999e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3002  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  63.75 
 
 		 293 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3318  chromosome partitioning ATPase protein-like  60.32 
 
 		 274 aa  291  9e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0337  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  49.81 
 
 		 269 aa  257  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00565629  normal  0.707159 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3887  chromosome partitioning protein  52.57 
 
 		 260 aa  256  4e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0820632  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1719  chromosome partitioning protein  47.71 
 
 		 295 aa  254  9e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.161268  normal  0.162144 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2118  ATPase  49.22 
 
 		 275 aa  249  4e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615389  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2795  ATPase MipZ  49.63 
 
 		 284 aa  246  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.116074  normal  0.419153 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0738  chromosome partitioning ATPase protein-like  50.57 
 
 		 269 aa  246  3e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1042  hypothetical protein  45.98 
 
 		 269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.689429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2703  chromosome partitioning protein  45.98 
 
 		 269 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4781  hypothetical protein  45.08 
 
 		 306 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0187  chromosome partitioning ATPase  47.51 
 
 		 269 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3563  ATPase MipZ  45.08 
 
 		 307 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2618  putative chromosome partitioning protein  46.39 
 
 		 269 aa  226  3e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2389  chromosome partitioning protein ParA  44.32 
 
 		 307 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.4126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3062  putative chromosome partitioning protein ParA  45.08 
 
 		 307 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.669279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3148  ATPase MipZ  46.67 
 
 		 278 aa  213  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.149057 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.11 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.39 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0391  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.03 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000118454  unclonable  0.000000000458103 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  28.04 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  36.72 
 
 		 213 aa  62  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  33.86 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.25 
 
 		 210 aa  62  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.06 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.06 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.06 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  26.87 
 
 		 207 aa  58.5  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.15 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.35 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.35 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  27.01 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.54 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  30.95 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.05 
 
 		 289 aa  57  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.33 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.91 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.54 
 
 		 220 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.87 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.87 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.51 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1360  ParA family protein, putative  33.55 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0573305  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.66 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.75 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.75 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0047  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.92 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  30.16 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.97 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.66 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0868  septum site-determining protein MinD  27.52 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.662974  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.66 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.54 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4151  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.95 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2127  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  27.71 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2409  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  30.16 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0359  sporulation initiation inhibitor protein soj  24.81 
 
 		 260 aa  55.5  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00437391  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1422  ParA family protein  30.16 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000341933  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2114  ParA family protein  30.16 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579771  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3176  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  30.16 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00741579  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1503  ParA family protein  30.16 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000197714  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3289  ParA family protein  30.16 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000336314  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1143  ParA family protein  30.16 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661225  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0025  para protein  30.33 
 
 		 222 aa  55.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00204905  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.07 
 
 		 231 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.07 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.66 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.07 
 
 		 231 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.11 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000187977 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1377  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.41 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.37 
 
 		 220 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0077  hypothetical protein  33.07 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.228977 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.05 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0108  hypothetical protein  33.33 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.327497  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5279  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.13 
 
 		 213 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0850  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.05 
 
 		 219 aa  53.9  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.668174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.32 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.83 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.24 
 
 		 255 aa  53.5  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.87 
 
 		 217 aa  53.5  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2164  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.85 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.441053  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0196  chromosome partitioning protein  25.3 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2068  putative partition-related protein  25.78 
 
 		 210 aa  53.1  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0001  putative replication protein A  28.04 
 
 		 408 aa  53.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.79 
 
 		 284 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.71 
 
 		 260 aa  53.5  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.28 
 
 		 206 aa  53.1  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  27.49 
 
 		 262 aa  53.1  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.02 
 
 		 254 aa  52.8  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.05 
 
 		 284 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2401  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.52 
 
 		 213 aa  52.8  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  30.25 
 
 		 222 aa  53.1  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.91 
 
 		 270 aa  52.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.63 
 
 		 217 aa  52.4  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0167  chromosome segregation ATPase  25 
 
 		 283 aa  52.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  31.61 
 
 		 201 aa  52.4  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.17 
 
 		 212 aa  52.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0846  ParA family protein  27.07 
 
 		 207 aa  52.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.89485  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  25.67 
 
 		 264 aa  52  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>