More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3002 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_3002  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  100 
 
 		 293 aa  598  1e-170  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3318  chromosome partitioning ATPase protein-like  64.45 
 
 		 274 aa  340  1e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2789  ATPase MipZ  63.75 
 
 		 267 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1719  chromosome partitioning protein  47.35 
 
 		 295 aa  254  9e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.161268  normal  0.162144 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0337  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  47.35 
 
 		 269 aa  249  6e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00565629  normal  0.707159 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0738  chromosome partitioning ATPase protein-like  47.51 
 
 		 269 aa  245  6e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2795  ATPase MipZ  46.24 
 
 		 284 aa  239  5e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.116074  normal  0.419153 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3887  chromosome partitioning protein  47.64 
 
 		 260 aa  236  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0820632  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2118  ATPase  45.67 
 
 		 275 aa  233  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615389  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1042  hypothetical protein  45.59 
 
 		 269 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.689429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2703  chromosome partitioning protein  45.59 
 
 		 269 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4781  hypothetical protein  42.91 
 
 		 306 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0187  chromosome partitioning ATPase  44.83 
 
 		 269 aa  225  6e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3563  ATPase MipZ  45.08 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3062  putative chromosome partitioning protein ParA  45.08 
 
 		 307 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.669279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2618  putative chromosome partitioning protein  42.8 
 
 		 269 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2389  chromosome partitioning protein ParA  43.56 
 
 		 307 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.4126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3148  ATPase MipZ  45.42 
 
 		 278 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.149057 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0391  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.85 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000118454  unclonable  0.000000000458103 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  25.53 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2630  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.51 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.84 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2890  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.51 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.52 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0226442  normal  0.408806 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.07 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  33.33 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  32.28 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.15 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  25.79 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  27.22 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  25.14 
 
 		 259 aa  55.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  27.27 
 
 		 207 aa  54.7  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.28 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.71 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.71 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.38 
 
 		 284 aa  54.3  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.87 
 
 		 212 aa  53.9  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.44 
 
 		 265 aa  53.9  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.43 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2127  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.15 
 
 		 238 aa  53.1  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0095  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.88 
 
 		 293 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4862  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.88 
 
 		 317 aa  52.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229675  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4668  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.68 
 
 		 255 aa  53.1  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016966  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.16 
 
 		 213 aa  52.8  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1205  septum site-determining protein MinD  31.82 
 
 		 265 aa  52.8  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.33 
 
 		 217 aa  52.8  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4303  chromosome partitioning protein  27.39 
 
 		 252 aa  52.4  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.12 
 
 		 254 aa  52.4  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1410  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.68 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.33 
 
 		 217 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4776  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.77 
 
 		 209 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.74468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.3 
 
 		 217 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.83 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5043  hypothetical protein  30.43 
 
 		 229 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000269108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.95 
 
 		 282 aa  50.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15195 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.3 
 
 		 217 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.62 
 
 		 212 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.62 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.23 
 
 		 209 aa  51.2  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.9 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.28 
 
 		 262 aa  50.8  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5783  chromosome segregation ATPase  28.48 
 
 		 333 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0183  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.32 
 
 		 221 aa  50.8  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150447  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5407  chromosome segregation ATPase  28.48 
 
 		 335 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.26 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.26 
 
 		 257 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2605  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.44 
 
 		 256 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0002  chromosome segregation ATPase  28.48 
 
 		 335 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.191041 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.88 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5408  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.98 
 
 		 301 aa  50.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.54 
 
 		 264 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3684  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.3 
 
 		 216 aa  50.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.444567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  26.36 
 
 		 206 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1377  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.47 
 
 		 211 aa  50.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.84 
 
 		 215 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.88 
 
 		 212 aa  49.7  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.49 
 
 		 282 aa  49.7  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.22 
 
 		 271 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  24.54 
 
 		 270 aa  50.1  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  25 
 
 		 264 aa  49.7  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.54 
 
 		 264 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.84 
 
 		 212 aa  50.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0095  ParA family chromosome partitioning ATPase  26.29 
 
 		 261 aa  49.7  0.00006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  65.71 
 
 		 256 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3835  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.71 
 
 		 316 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10007  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0107  ParA family chromosome partitioning ATPase  26.29 
 
 		 261 aa  49.7  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5757  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.54 
 
 		 215 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0135  ParA family chromosome partitioning ATPase  26.29 
 
 		 261 aa  49.7  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3164  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.17 
 
 		 259 aa  49.3  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7333  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.71 
 
 		 470 aa  49.3  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946911  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3111  chromosome segregation ATPase  27.75 
 
 		 345 aa  49.3  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0702646  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.84 
 
 		 229 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2449  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32 
 
 		 219 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0538918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.79 
 
 		 231 aa  49.3  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.46 
 
 		 251 aa  49.3  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.84 
 
 		 229 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32 
 
 		 219 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  22.4 
 
 		 253 aa  49.3  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2444  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32 
 
 		 219 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0108  hypothetical protein  32.81 
 
 		 209 aa  49.3  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.327497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>