More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3563 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3563  ATPase MipZ  100 
 
 		 307 aa  628  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2389  chromosome partitioning protein ParA  83.66 
 
 		 307 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.4126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3062  putative chromosome partitioning protein ParA  82.41 
 
 		 307 aa  507  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.669279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4781  hypothetical protein  75.66 
 
 		 306 aa  464  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2795  ATPase MipZ  52.16 
 
 		 284 aa  265  8.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.116074  normal  0.419153 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1719  chromosome partitioning protein  48.3 
 
 		 295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.161268  normal  0.162144 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1042  hypothetical protein  50 
 
 		 269 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.689429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2703  chromosome partitioning protein  50 
 
 		 269 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0187  chromosome partitioning ATPase  48.86 
 
 		 269 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0337  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  44.32 
 
 		 269 aa  230  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00565629  normal  0.707159 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2118  ATPase  44.32 
 
 		 275 aa  229  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615389  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0738  chromosome partitioning ATPase protein-like  46.97 
 
 		 269 aa  228  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2789  ATPase MipZ  45.08 
 
 		 267 aa  227  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3002  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  45.28 
 
 		 293 aa  223  4e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3887  chromosome partitioning protein  45.08 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0820632  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2618  putative chromosome partitioning protein  42.91 
 
 		 269 aa  211  9e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3318  chromosome partitioning ATPase protein-like  44.44 
 
 		 274 aa  206  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3148  ATPase MipZ  43.94 
 
 		 278 aa  205  9e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.149057 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.1 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.27 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  28.66 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  29.67 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H08  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  25.17 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.129369  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  33.09 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  26.99 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.99 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0391  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.14 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000118454  unclonable  0.000000000458103 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  30.64 
 
 		 201 aa  58.5  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.22 
 
 		 217 aa  58.9  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.22 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1576  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.14 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332666  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  30.45 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.85 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.2 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.2 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0438  putative CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  26.62 
 
 		 250 aa  57  0.0000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.132493  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0025  para protein  29.5 
 
 		 222 aa  57  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00204905  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.82 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0076  chromosome segregation ATPase  27.39 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.5 
 
 		 339 aa  55.8  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.58 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  29.86 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0188  chromosome partitioning protein ParA  24.34 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0777  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.5 
 
 		 257 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0129955 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4303  chromosome partitioning protein  29.85 
 
 		 252 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  28.57 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.36 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.22 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.49 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.45 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3784  septum site-determining protein MinD  29.56 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0077808  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  25.7 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0054  chromosome segregation ATPase  27.39 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.76 
 
 		 212 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.45 
 
 		 254 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.808609 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.94 
 
 		 229 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.11 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.627572  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3903  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.75 
 
 		 263 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  27.45 
 
 		 348 aa  53.9  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K15  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  25.68 
 
 		 249 aa  53.9  0.000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000000399891  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0029  chromosome segregation ATPase  26.11 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.158889 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0552  septum site-determining protein MinD  27.46 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.27 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.63 
 
 		 252 aa  54.3  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.1 
 
 		 255 aa  53.5  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  25.75 
 
 		 268 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0030  chromosome segregation ATPase  25.75 
 
 		 263 aa  53.5  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  25.95 
 
 		 265 aa  53.9  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  28.17 
 
 		 206 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.22 
 
 		 257 aa  53.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  28.31 
 
 		 314 aa  53.1  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  27.52 
 
 		 256 aa  53.5  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.1 
 
 		 257 aa  53.1  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.03 
 
 		 256 aa  53.5  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.73 
 
 		 262 aa  53.1  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.67 
 
 		 258 aa  53.1  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3521  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.65 
 
 		 261 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000641788 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2950  hypothetical protein  26.63 
 
 		 256 aa  53.1  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1153  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.38 
 
 		 258 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.488153  normal  0.157692 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3966  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.83 
 
 		 265 aa  53.1  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0051  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.09 
 
 		 261 aa  53.1  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0497583  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2804  hypothetical protein  26.63 
 
 		 256 aa  52.8  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3196  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.65 
 
 		 261 aa  52.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0022  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.68 
 
 		 257 aa  52.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.695943  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.82 
 
 		 284 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163786  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.16 
 
 		 215 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0226442  normal  0.408806 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73350  chromosome partitioning protein Soj  26.09 
 
 		 262 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6365  chromosome partitioning protein Soj  26.09 
 
 		 262 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4199  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.15 
 
 		 256 aa  52.8  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000176763 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1769  hypothetical protein  28.06 
 
 		 222 aa  52.8  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.00507269 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00431  chromosome partitioning ATPase  24.69 
 
 		 257 aa  52.8  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1423  ParA family ATPase  27.27 
 
 		 468 aa  52.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273364  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.27 
 
 		 468 aa  52.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.770946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5408  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.93 
 
 		 301 aa  52.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.08 
 
 		 217 aa  52.4  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5045  parA family protein  25.6 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0095  ParA family chromosome partitioning ATPase  24.84 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4862  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.12 
 
 		 317 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229675  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0107  ParA family chromosome partitioning ATPase  24.84 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.4 
 
 		 284 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>