More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2618 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2618  putative chromosome partitioning protein  100 
 
 		 269 aa  549  1e-155  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0337  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  70.26 
 
 		 269 aa  394  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00565629  normal  0.707159 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0738  chromosome partitioning ATPase protein-like  69.52 
 
 		 269 aa  378  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1042  hypothetical protein  69.52 
 
 		 269 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.689429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2703  chromosome partitioning protein  69.52 
 
 		 269 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0187  chromosome partitioning ATPase  68.77 
 
 		 269 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3887  chromosome partitioning protein  65.8 
 
 		 260 aa  352  5e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0820632  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1719  chromosome partitioning protein  50.93 
 
 		 295 aa  260  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.161268  normal  0.162144 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2795  ATPase MipZ  50.57 
 
 		 284 aa  255  7e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.116074  normal  0.419153 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2118  ATPase  48.5 
 
 		 275 aa  235  6e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615389  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3148  ATPase MipZ  46.74 
 
 		 278 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.149057 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2789  ATPase MipZ  46.39 
 
 		 267 aa  226  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3318  chromosome partitioning ATPase protein-like  44.53 
 
 		 274 aa  221  7e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3002  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  42.8 
 
 		 293 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3563  ATPase MipZ  42.91 
 
 		 307 aa  212  7e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4781  hypothetical protein  40.52 
 
 		 306 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3062  putative chromosome partitioning protein ParA  41.54 
 
 		 307 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.669279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2389  chromosome partitioning protein ParA  40.44 
 
 		 307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.4126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.59 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0051  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.95 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0497583  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  29.59 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  32.16 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8198  replication protein A  32.74 
 
 		 403 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  31.79 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4354  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.15 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0029  chromosome segregation ATPase  29.7 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.158889 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.7 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.627572  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.17 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0346  septum site-determining protein MinD  32.43 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  28.9 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  30 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.32 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  30.06 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.58 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.293601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.73 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0076  chromosome segregation ATPase  29.01 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  29.81 
 
 		 264 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.59 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  30.67 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.56 
 
 		 210 aa  62  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0054  chromosome segregation ATPase  28.92 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  28.57 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.31 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4199  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.67 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000176763 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.03 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3561  plasmid partitioning protein RepA  27.6 
 
 		 405 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.95 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.88 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1217  ParA family protein  28.25 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2890  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.52 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  29.38 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.4 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.06 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.74 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  30.52 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.52 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.57 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.57 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  28.57 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.57 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.57 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.57 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.57 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1820  septum site-determining protein MinD  32 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.57 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.66 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  28.57 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2630  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.09 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0552  septum site-determining protein MinD  28.19 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  25.86 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.661673 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6317  plasmid partitioning protein RepA  25.86 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2491  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.09 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.926396  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3736  plasmid partitioning protein RepA  27.37 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2545  septum site-determining protein MinD  29.95 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000689813  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5775  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.18 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.52 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.808609 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  27.78 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.95 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  27.66 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7172  plasmid partitioning protein RepA  29.76 
 
 		 398 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.300814 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.84 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3782  chromosome segregation ATPase  26.42 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000230675 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.67 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5045  parA family protein  27.63 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3521  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.99 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000641788 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.29 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0014  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.6 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386166  hitchhiker  0.000800579 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  24.29 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2164  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.441053  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3196  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.99 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3163  septum site-determining protein MinD  32.16 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2449  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.42 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0538918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0667  septum site-determining protein MinD  32.16 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04092  transcriptional regulator of chromosome partitioning protein; ParA family protein; could be a protein tyrosine kinase  27.85 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4023  ATPase, ParA type  29.88 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.845906  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.42 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4567  septum site-determining protein MinD  32.16 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109943  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.98 
 
 		 404 aa  56.2  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>