More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2795 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2795  ATPase MipZ  100 
 
 		 284 aa  571  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.116074  normal  0.419153 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1042  hypothetical protein  55.89 
 
 		 269 aa  295  8e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.689429  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1719  chromosome partitioning protein  54.75 
 
 		 295 aa  293  2e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.161268  normal  0.162144 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2703  chromosome partitioning protein  55.51 
 
 		 269 aa  292  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0187  chromosome partitioning ATPase  55.51 
 
 		 269 aa  289  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2389  chromosome partitioning protein ParA  51.69 
 
 		 307 aa  275  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.4126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0738  chromosome partitioning ATPase protein-like  53.99 
 
 		 269 aa  275  4e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0337  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  52.85 
 
 		 269 aa  275  6e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00565629  normal  0.707159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3563  ATPase MipZ  52.06 
 
 		 307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4781  hypothetical protein  51.48 
 
 		 306 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3062  putative chromosome partitioning protein ParA  52.06 
 
 		 307 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.669279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3887  chromosome partitioning protein  52.47 
 
 		 260 aa  268  7e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0820632  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2118  ATPase  51.33 
 
 		 275 aa  266  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615389  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2618  putative chromosome partitioning protein  50.57 
 
 		 269 aa  264  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2789  ATPase MipZ  49.26 
 
 		 267 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3002  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  47.37 
 
 		 293 aa  248  6e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3148  ATPase MipZ  46.36 
 
 		 278 aa  239  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.149057 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3318  chromosome partitioning ATPase protein-like  45.99 
 
 		 274 aa  235  6e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.08 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.72 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.808609 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  27.22 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.77 
 
 		 257 aa  57  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.3 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.627572  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00431  chromosome partitioning ATPase  32 
 
 		 257 aa  57  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0029  chromosome segregation ATPase  32.3 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.158889 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002021  ParA family protein  31.33 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000141399  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5045  parA family protein  31.33 
 
 		 268 aa  55.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.94 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3365  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.71 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2946  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.71 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204641  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  29.88 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0188  chromosome partitioning protein ParA  31.71 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0507089  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.5 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.293601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3164  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.83 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3005  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.71 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.67 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  26.74 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3980  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  31.71 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1597  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.71 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00287402  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4054  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  31.71 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  26.25 
 
 		 257 aa  53.9  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2950  hypothetical protein  27.36 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2519  ParA family protein  30.67 
 
 		 257 aa  53.9  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.3 
 
 		 257 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2804  hypothetical protein  27.36 
 
 		 256 aa  53.5  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  30.19 
 
 		 256 aa  53.5  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.01 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.4 
 
 		 261 aa  53.1  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0896384  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.79 
 
 		 256 aa  53.1  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0030  chromosome segregation ATPase  32.52 
 
 		 263 aa  52.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.67 
 
 		 256 aa  52.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0054  chromosome segregation ATPase  30.72 
 
 		 256 aa  52.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.44 
 
 		 273 aa  52.8  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  27.44 
 
 		 273 aa  52.8  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  27.15 
 
 		 258 aa  52.4  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  26.88 
 
 		 257 aa  52.4  0.000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5615  plasmid partitioning protein RepA  30.77 
 
 		 408 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.199114 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.24 
 
 		 253 aa  52.4  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  30.41 
 
 		 253 aa  52.4  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28 
 
 		 284 aa  52.4  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4517  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.71 
 
 		 401 aa  52.4  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5407  chromosome segregation ATPase  28.4 
 
 		 335 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0002  chromosome segregation ATPase  28.4 
 
 		 335 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.191041 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.17 
 
 		 302 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.68 
 
 		 312 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0051  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.76 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0497583  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2960  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.67 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5783  chromosome segregation ATPase  28.4 
 
 		 333 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  28.18 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.67 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7093  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.7 
 
 		 339 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3326  putative chromosome partitioning protein PARA  29.63 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00529695  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4789  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.38 
 
 		 387 aa  50.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.076168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3521  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.63 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000641788 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.05 
 
 		 306 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3736  plasmid partitioning protein RepA  27.91 
 
 		 408 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0237  chromosome partitioning ATPase  22.87 
 
 		 279 aa  51.6  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3318  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.1 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3196  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.63 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1056  chromosome partitioning ATPase  28.48 
 
 		 457 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.55142  hitchhiker  0.00567029 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1631  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.67 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.423414  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3504  chromosome segregation ATPase  31.68 
 
 		 257 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.25082 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.58378  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0112  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.71 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.25 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.47 
 
 		 336 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.68 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.63 
 
 		 317 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3653  ParA family protein  32.03 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109435  hitchhiker  0.0000954297 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2127  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.2 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0006  ParA family protein  23.46 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0843826  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.67 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.56 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  29.2 
 
 		 213 aa  50.4  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 		 262 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.67 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04092  transcriptional regulator of chromosome partitioning protein; ParA family protein; could be a protein tyrosine kinase  30.92 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.41 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.67 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.95 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>